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In dieser Dissertation wurden sequenz- und strukturbasierte Beschreibungen von RNA-Klassen, insbesondere von Ribozymen erstellt. Diese Beschreibungen dienten dazu, öffentlich zugängliche Genomdatenbanken auf Vorkommen der betreffenden Klassen zu untersuchen. Die gefundenen Motive wurden sowohl im Dateisystem, als auch in einer MySQL-Datenbank gespeichert und durch einen ProServer visualisiert. Die Arbeit zielt damit darauf ab, die Verbreitung der Motive zu analysieren und zu annotieren, um somit Einblicke in deren Evolution zu erhalten. In einem zweiten Projekt wurden RNA Deep Sequencing Daten eines Wildtyps und einer Gendeletionsmutante einer RNA-abhängigen RNA-Polymerase aus Dictyostelium discoideum ausgewertet, um den Einfluss auf Retrotransposons und die Genregulation durch RNA-Moleküle zu untersuchen. |
