Bandits neuronaux pour la détection de polypharmacies potentiellement inapropriées

Autor: Larouche, Alexandre
Jazyk: francouzština
Rok vydání: 2023
Předmět:
Druh dokumentu: Texte::Thèse::Mémoire de maîtrise
Popis: Titre de l'écran-titre (visionné le 15 mai 2023)
La polypharmacie, le plus souvent définie comme étant la prise simultanée de 5 médicaments ou plus par un patient, est un phénomène prévalent chez les aînés. Certaines polypharmacies peuvent être considérées comme inappropriées si elles sont associées avec un événement de santé négatif comme la mort ou l'hospitalisation, il est donc crucial de les identifier. Cependant, l'énorme quantité de combinaisons de médicaments possibles, la taille des bases de données de réclamation ainsi que le coût en temps nécessaire afin de calculer une mesure d'association exacte rend cette tâche impossible à résoudre par des méthodes par force brute. Ainsi, nous proposons l'utilisation de stratégies de bandits capable d'optimiser la navigation de jeux de données de polypharmacies générés à partir de bases de données de réclamation. Nous commençons d'abord ce mémoire en posant le problème de détection de polypharmacies potentiellement inappropriées et en décrivant les données reliées à la tâche, soit les données réelles du Système intégré de surveillance des maladies chroniques du Québec ainsi que les données synthétiques utilisées dans nos expériences, générées par un simulateur que nous avons développé. Ensuite, nous définissons une représentation neuronale suffisante à l'apprentissage de la relation entre des combinaisons de médicaments et une mesure d'association à un événement de santé. Nous abordons ensuite le problème d'entraînement d'un réseau de neurones sous forme de problème d'optimisation bandit. À cette fin, une version adaptée de la stratégie NeuralTS, OptimNeuralTS, est introduite. Cette stratégie, capable de surmonter les obstacles du contexte de polypharmacie, réussit à générer de petits jeux de données sur lesquels peuvent s'entraîner des modèles prédictifs afin de classifier l'association positive ou négative d'une combinaison de médicaments à un événement de santé. Nos résultats sur des jeux de données synthétiques montrent que la stratégie OptimNeuralTS rend possible l'entraînement de modèles prédictifs capable d'effectuer la détection de combinaisons de médicaments avec un risque accru d'événement de santé même si celles-ci n'ont jamais été vues durant l'entraînement. Le déploiement de cette méthode sur les données réelles a également permis l'extraction de telles combinaisons. Cependant, une analyse plus poussée de ces combinaisons révèle également que le risque accru observé pour la plupart d'entre elles provient plutôt de facteurs externes. Néanmoins, certains résultats motivent une étude plus poussée de certaines combinaisons méconnues.
Polypharmacy, most often defined as the simultaneous consumption of five or more drugs at once, is a prevalent phenomenon in the older population. Some of these polypharmacies, deemed inappropriate, may be associated with adverse health outcomes such as death or hospitalization. Considering the number of possible drug combinations as well as the size of claims database and the cost to compute an exact association measure for a given drug combination, it is impossible to investigate every possible combination of drugs. As such, we propose to optimize the search for potentially inappropriate polypharmacies in datasets extracted from claims databases by using bandit strategies. We first define the problem of detecting potentially inappropriate polypharmacies and describe the different data sources used, that is, the real data from the Système intégré de surveillance des maladies chroniques du Québec as well as the synthetic data used in our experiments, generated by a simulator we have developed. Following this, we define a neural representation sufficient to learn the relationship between drug combinations and an association measure to a health outcome. We then tackle the problem of training such supervised neural networks by formulating it as a bandit optimization problem. To this end, we introduce an adapted version of the NeuralTS strategy called OptimNeuralTS. This strategy, capable of overcoming the challenges associated with the polypharmacy context, succeeds in generating small training datasets used to train predictive models in order to classify a drug combination as positively or negatively associated with a given health outcome. Our results on synthetic datasets show that OptimNeuralTS is able to train predictive models capable of detecting drug combinations which exhibit an increased risk of health events, even if they have never been seen during training. The deployment of this method on the real data also yields such combinations. However, further analysis of these combinations shows that the higher risk is associated to external factors such as prior health conditions for most of them. Nevertheless, some extracted drug combinations remain interesting to health experts and will be studied further.
Databáze: Networked Digital Library of Theses & Dissertations
Externí odkaz: