Análise de populações de Sclerotinia sclerotiorum em cultura de feijoeiro através de marcadores SSR.
| Autor: | GOMES, Eriston Vieira |
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| Jazyk: | portugalština |
| Rok vydání: | 2011 |
| Předmět: | |
| Zdroj: | Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFGUniversidade Federal de GoiásUFG. |
| Druh dokumentu: | masterThesis |
| Popis: | Made available in DSpace on 2014-07-29T15:16:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Eriston Vieira Gomes.pdf: 1068459 bytes, checksum: 42c6dd1935f5ad9ce49cfd644bc60d66 (MD5) Previous issue date: 2009-09-30 79 Sclerotinia sclerotiorum isolates were collected under central pivot irrigations sistems, from Brazilian fields, divided in 4 populations (S2, S3, A and M) and analyzed to determine the genetic variability among and between populations using molecular markers based on microsatelittes. 10 primers were used and the amplification products were separate in poliacrilamida gels and the bands were silver stained. A total of 102 different haplotypes were identified, and the amount of haplotypes varied from 6 to 18 for locus. The genotypic diversity ranged from 65% to 91%. Analyses based on genetic diversity and fixation indices which indicate the variability between populations was 28.79% (FST = 28793) and the variability among populations was 71.21%. The Jaccard similarity index indicated that the populations S2 and A is genetically closer. The population S3 presented a similarity index of 0.44 compared with the populations S2 and A. The population M, originated from several collection sites, was considered genetically more distant showing a index of 0.46 compared with the others populations. The high variability between and among populations can indicate that, besides the possible introduction of new genotypes in the analyzed fields, could be having clonal and sexual reproduction in isolated of S. sclerotiorum from Brazilian cerrado. Foram coletados 79 isolados de S. sclerotiorum, sob sistemas de irrigação por pivô central, provenientes da região do entorno de Brasília DF, divididos em 4 populações (S2, S3, A e M) e analisados, quanto a sua variabilidade intra e interpopulações utilizando marcadores moleculares baseados em microssatélites. Foram utilizados 10 conjuntos de oligonucleotídeos e o produto de amplificação desses marcadores foram separados em géis de poliacrilamida e corados com nitrato de prata. Um total de 102 alelos foram identificados, sendo que a quantidade de alelos variou de 6 a 18 por lócus e a diversidade alélica variou de 65% a 91%. A variabilidade entre as populações foi de 28.79% (Fst = 28793) e a variabilidade dentro das populações foi de 71.21%. O índice de similaridade de Jaccard indicou que as populações S2 e A são as populações geneticamente mais próximas, a população S3 apresentou um índice de similaridade de 0.44 em relação as populações S2 e A e a população M proveniente de vários sítios de coleta foi considerada a população geneticamente mais distante. A alta variabilidade dentro e entre populações pode indicar que esteja havendo reprodução tanto sexuada como assexuada em isolados de S. sclerotiorum da região do entorno de Brasília DF. |
| Databáze: | Networked Digital Library of Theses & Dissertations |
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