Detecção de locos de características quantitativas com efeito da origem parental dos alelos nos cromossomos 1, 2 e 4 de suínos
| Autor: | Silva Filho, Miguel Inácio da |
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| Jazyk: | portugalština |
| Rok vydání: | 2011 |
| Předmět: | |
| Zdroj: | Repositório Institucional da UFVUniversidade Federal de ViçosaUFV. |
| Druh dokumentu: | masterThesis |
| Popis: | Made available in DSpace on 2015-03-26T13:42:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1580756 bytes, checksum: 350f6dfe8f9943efab139b47104445dc (MD5) Previous issue date: 2010-02-23 Data from an F2 swine population, consisting of 600 animals derived from crosses between Piau sires and Commercial dams were used in order to detect QTL with parent-of-origin effects. Phenotypic data on performance, carcass, internal organs, viscera, carcass cuts and meat quality traits were collected in the F2 animals. The population was genotyped for 16 microsatellite loci covering the chromosomes 1, 2 and 144. Based on the genotypes a specific linkage map was constructed for this population. Association analyses were performed using interval mapping by regression for QTL detection. A decision tree for identifying QTL with parent-of-origin effects based on tests against the Mendelian mode of expression was used. Twenty three QTL were detected using the Mendelian model of analysis, three on the chromosome one, five on chromosome two and 15 on chromosome four. It was also detected 12 QTL with parentof-origin effects. Six of these QTL were identified on chromosome one, where three were paternally expressed and three were maternally expressed. Three QTL were detected on chromosome two, where one was paternally expressed and the other two were maternally expressed. The remaining three QTL were identified on chromosome four, all of them were paternally expressed. None of the QTL with parent-of-origin effects was detected by the Mendelian model. The results generated in this study may contribute to a better understanding of the genetic mechanisms involved in the control of quantitative traits. Com o objetivo de detectar QTL com efeito da origem parental dos alelos, foram utilizados dados de uma população F2 de suínos, composta de 600 animais, obtidos a partir do cruzamento de machos Piau e fêmeas comerciais. Nos animais F2, foram avaliadas características de desempenho, carcaça, órgãos e vísceras, cortes de carcaça e qualidade de carne. Para a genotipagem de todos os animais, foram utilizados 16 locos de microssatélites distribuídos nos cromossomos 1, 2 e 4. Com o resultado da genotipagem, foi construído o mapa de ligação específico dos marcadores para a população desenvolvida. As análises de associação foram baseadas no mapeamento por intervalo usando métodos de regressão. Para identificar QTL com efeito da origem parental dos alelos, foi utilizada uma árvore de decisão baseada em testes contra o modelo de expressão Mendeliana. Usando o método de análise para esse tipo de expressão, foram detectados 23 QTL mendelianos: três no cromossomo 1, cinco no cromossomo 2 e 15 no cromossomo 4. Foram detectados também 12 QTL com efeito da origem parental dos alelos: seis no cromossomo 1 (três de expressão paterna e três de expressão materna), outros três no cromossomo 2 (um de expressão paterna e os outros dois de expressão materna) e três no cromossomo 4 (todos de expressão paterna). Nenhum dos QTL com efeito da origem parental dos alelos foi identificado pelo modelo Mendeliano. Os resultados obtidos podem contribuir para o melhor entendimento dos mecanismos genéticos envolvidos no controle das características quantitativas. |
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