LPS- PCR تاپینگ ایزوله‌های ایرانی پاستورلامولتوسیدای گوسفندی، براساس ژن‌های بیوسنتزکننده هسته خارجی (1L تا 8LPS (L

Autor: سیده فهیمه میرحق‌گوی جلالی, احمدرضا جباری, مجید اسمعیلی زاد
Jazyk: English<br />French
Rok vydání: 2017
Předmět:
Zdroj: Archives of Razi Institute, Vol 72, Iss 3, Pp 165-171 (2017)
Druh dokumentu: article
ISSN: 0365-3439
2008-9872
DOI: 10.22092/ari.2017.111607
Popis: پاستورلا مولتوسیدا یک باکتری گرم منفی است که عامل ایجاد بیماری­های مختلفی در بسیاری از گونه های حیوانی و انسانی می­باشد. آنچه که آشکار است LPS یک فاکتور بیماری­زای مهم می باشد که هر تغییر کوچکی در ساختار LPS باعث اثرات اساسی در توانایی ایجاد بیماری توسط پاستورلا مولتوسیدا در میزبانش می­شود و نیزLPS می­تواند به عنوان یک فاکتور مهم در سیستم تایپینگ سوماتیک، برای شناسایی و طبقه بندی باکتری مورد استفاده قرار گیرد. ژنوتیپLPS جدایه های گوسفندی، با استفاده از 8 جفت پرایمر اختصاصی ژن های بیوسنتزهسته خارجی LPS تعیین شدند. سپس ژن­های LPS تکثیر یافته به وسیله واکنش زنجیره­ای پلیمراز، تعیین توالی شده و با توالی­های موجود در بانک ژن مورد مقایسه قرار گرفتند. از 32 جدایه پاستورلا مولتوسیدای گوسفندی مورد آزمایش، 21 جدایه با فراوانی (62/65%) دارای ژنوتیپ 6L، 9 جدایه با فراوانی( 12/28%) دارای ژنوتیپ 3L، 1 جدایه با فراوانی( 12/3%) شامل هر دو ژنوتیپ 3L و 6L بودند. 1 جدایه با فراوانی (12/3%) غیر قابل تیپ بندی بود. روش LPS-PCR توانست ژنوتیپ 31 مورد از 32 جدایه فیلدی مورد مطالعه را تعیین نماید. بر اساس آنالیز فیلوژنتیکی، جدایه­های ژنوتیپ L3 در دو زیر شاخه مجزا قرار گرفتند. درصد تشابه توالی ژن های LPS در بین جدایه­های گوسفندی ژنوتیپ با توالی­های موجود در بانک ژن بطور قابل توجهی بالا (5/99%>) بود. LPS-PCR یک روش ژنوتایپینگ دقیق است که می­تواند سویه های پاستورلا مولتوسیدا را در یکی از هشت ژنوتیپ LPS طبقه بندی نماید.
Databáze: Directory of Open Access Journals