ارزیابی بیان ژن‌های اکسیدکنندۀ آهن و گوگرد در باکتری سولفوباسیلوس ترموسولفیدواکسیدانس تحت‌تأثیر شاخص‌های مؤثر در فرایند آبشویۀ میکروبی

Autor: کورش پورمحمودیان, فرخ رخ بخش زمین, احمد مغوئی نژاد, محمد هاشم آبادی
Jazyk: English<br />Persian
Rok vydání: 2020
Předmět:
Zdroj: Biological Journal of Microorganism, Vol 9, Iss 35, Pp 17-28 (2020)
Druh dokumentu: article
ISSN: 2322-5173
2322-5181
DOI: 10.22108/bjm.2020.120297.1246
Popis: مقدمه: تأثیر آنزیم سولفات‌آدنیلیل‌ترانسفراز بر آدنوزین‌مونوفسفات سبب تولید ترکیبات سولفات و ATP می‌شود که مرحلۀ نهایی اکسیداسیون سولفیت برای کسب انرژی است. در سیستم آبشویۀ میکروبی، آنزیم 4Fe-4S فردوکسین (عضو زنجیرۀ انتقال الکترون) نقش مهمی را در اکسیداسیون آهن فرو ایفا می‌کند. تلاش به‌منظور بهینه‌کردن شرایط رشد باکتری، افزایش بیان ژن‌ها را در پی خواهد داشت که با افزایش بازده سیستم آبشویۀ میکروبی همراه می‌شود؛ بنابراین هدف پژوهش حاضر، بررسی بیان ژن‌های مربوط به این پروتئین‌ها در باکتری سولفوباسیلوس ترموسولفیدواکسیدانس همراه با اعمال تغییر در عوامل تأثیرگذار در محیط‌کشت استفاده‌شده در نظر گرفته شد. مواد و روش‏‏ها: کشت باکتری‌ها در محیط پایۀ 9K با غلظت‌های متفاوتی از کنسانترۀ کالکوپیریتی‌، یون آهن فرو و عصارۀ مخمر انجام شد. پس‌از رشد باکتری‌ها و تخلیص آنها، استخراج RNA باکتری و ساخت cDNA انجام شد. به‌منظور بررسی میزان بیان ژن‌های یادشده، واکنش Real Time PCR انجام و تجزیه‌وتحلیل نتایج به روش ∆∆CT-2 انجام شد. نتایج با آزمون‌های توکی و دانکن و با نرم‌افزار SPSS (نسخۀ 21) در سطح p ˂0.05 بررسی شدند. نتایج: باتوجه‌به نتایج PCR، ژن‌های مدنظر شناسایی و آغازگرها تأیید شدند. بین چهار محیط آزمایش‌شده، بیشترین درصد استخراج مس به محیط شمارۀ 2 با میزان 75/48 درصد مربوط بود که در آن، ژن 4Fe-4S فردوکسین بیشترین بیان را نسبت به دیگر محیط‌های آزمایش داشت. بیشترین بیان ژن سولفات‌آدنیلیل‌‌ترانسفراز به محیط شمارۀ 4 مربوط بود که درصد استخراج مس در آن 16/39 درصد بود. بحث و نتیجه‏گیری: ترکیبات محیط‌کشت باکتری بیان ژن‌ها و درصد استخراج مس را تغییر دادند و مناسب‌ترین حالت محیط آزمایش برای استخراج مس در اندازه ذرات 10 میکرون، حضور 5/1 گرم‌بر‌لیتر یون آهن فرو و حضورنداشتن عصارۀ مخمر به دست آمد.
Databáze: Directory of Open Access Journals