Towards a comprehensive evaluation of dimension reduction methods for transcriptomic data visualization

Autor: Haiyang Huang, Yingfan Wang, Cynthia Rudin, Edward P. Browne
Jazyk: angličtina
Rok vydání: 2022
Předmět:
Zdroj: Communications Biology, Vol 5, Iss 1, Pp 1-11 (2022)
Druh dokumentu: article
ISSN: 2399-3642
DOI: 10.1038/s42003-022-03628-x
Popis: The authors provide an evaluation framework for dimension reduction methods that illuminates the strengths and weaknesses of different algorithms, and applies this framework to evaluate the PCA, t-SNE, UMAP, TriMap, PaCMAP, ForceAtlas2, and PHATE algorithms.
Databáze: Directory of Open Access Journals
Nepřihlášeným uživatelům se plný text nezobrazuje