Estructura y variabilidad genética del bisonte americano (Bison bison) en México

Autor:	Joel Domínguez-Viveros, Guadalupe Nelson Aguilar-Palma, Rafael Villa-Angulo, Nancy Hernández-Rodríguez, José Manuel Pérez-Cantú, Flora Moir, Pedro Calderón-Domínguez
Jazyk:	English<br />Spanish; Castilian
Rok vydání:	2023
Předmět:	Heterocigosis Recursos genéticos Tamaño efectivo de población Consanguinidad Conservación SNP Animal culture SF1-1100 Veterinary medicine SF600-1100
Zdroj:	Revista Mexicana de Ciencias Pecuarias, Vol 14, Iss 2 (2023)
Druh dokumentu:	article
ISSN:	2007-1124 2448-6698
DOI:	10.22319/rmcp.v14i2.6250
Popis:	Los objetivos fueron analizar la estructura y variabilidad genética del bisonte americano con marcadores genéticos de tipo SNP. Se muestrearon 174 bisontes y se analizaron 42,366 SNP distribuidos en los 29 cromosomas. Se estimó la heterocigosis esperada (He) y observada (Ho), contenido de información polimórfica (CIP), índice de fijación (FIS), índice de Shannon (IS), desequilibrio de ligamiento y relación de parentesco (Rij; %), así como el tamaño efectivo de población (Ne). Se realizó un análisis de estructura genética para inferir cuántas líneas o genomas (k) definen la población. Se identificó y seleccionó un panel con 2,135 SNP polimórficos, con un promedio de 74 SNP por cromosoma. En el proceso de exclusión, 84.5 % fueron monomórficos, 8.5 % con porcentaje de usables menor a 90 %, 6.3 % con frecuencia del alelo menor inferior a 0.01 y 0.70 % por desequilibrio Hardy-Weinberg (P
Databáze:	Directory of Open Access Journals
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