بهبود ارزیابی ژنومی گاوهای هلشتاین با استفاده از ماتریس روابط ژنومی بر پایه اطلاعات هاپلوتایپ ها

Autor:	مهرنوش فروتن, سعید انصاری مهیاری, فلاویو شنکل, مهدی سرگلزایی
Jazyk:	perština
Rok vydání:	2018
Předmět:	صحت اریبی برآوردها ماتریس روابط خویشاوندی ژنومیکی هاپلوتایپ گاو هلشتاین Animal culture SF1-1100
Zdroj:	پژوهشهای علوم دامی ایران, Vol 10, Iss 3, Pp 393-402 (2018)
Druh dokumentu:	article
ISSN:	2008-3106 2423-4001
DOI:	10.22067/ijasr.v10i3.66156
Popis:	امروزه استفاده از اطلاعات هاپلوتایپ‌ به منظور تخمین ارزش ‌اصلاحی ژنومی (GEBV) با صحت و دقت بالاتر مورد توجه قرار گرفته است. استفاده از شباهت بین هاپلوتایپ ها نسبت به مستقل در نظر گرفتن اثرات هاپلوتایپ‌ها می‌تواند منجر به قابلیت پیش‌گویی بالاتر برآوردهای ژنومی ‌گردد. هدف از این مطالعه بررسی صحت و اریبی GEBV به روش بهترین برآورد نااریب خطی ژنومی (GBLUP) با استفاده از ماتریس روابط خویشاوندی ژنومی بر پایه اطلاعات نشانگرهای چندشکلی تک نوکلئوتیدی (GSNP) و هاپلوتایپ‌ (GHAP) و ماتریس هیبرید شامل اطلاعات هاپلوتایپ‌ها وSNPها (GSNP,HAP) بود. ماتریس‌های روابط خویشاوندی ژنومی با استفاده از تراشه k50 برای جمعیت گاو شیری هلشتاین آمریکای شمالی برای صفات تولید چربی شیر، تولید شیر، نمره سلول بدنی، تیپ و روزهای باز تشکیل گردید. مقادیر صحت GEBV با استفاده از ماتریس GSNP و GHAP به ترتیب از 49/0 (روزهای باز) تا 72/0 (تولید چربی شیر) و 50/0(روزهای باز) تا 73/0 (تولید چربی شیر) متغیر بود. استفاده از ماتریس GHAP در مقایسه با دیگر ماتریس های مورد بررسی در این مطالعه منجر به برآوردهای نااریب‌تری در تمام صفات شد. استفاده از ماتریس GHAP نسبت به GSNP موجب 6 تا 15 درصد کاهش اریبی برآوردها در صفات مختلف گردید. یکی از دلایل بهبود اریبی برآوردها می تواند برآورد بهتر واریانس ژنتیکی در سطح جمعیت توسط هاپلوتایپ نشانگرها نسبت به نشانگر انفرادی باشد. بر اساس نتایج حاضر ماتریس GHAP می تواند جایگزین مناسبی برای GSNP در ارزیابی های ژنومی به منظور دستیابی به برآوردهای ارزش اصلاحی نااریب تر و دقیق تر باشد.
Databáze:	Directory of Open Access Journals
Externí odkaz:	https://doaj.org/article/daa9180293984154b626b9e9682fedd6 Zobrazit plný text záznamu View record in DOAJ