Aislamiento de microRNAs a partir de células clorofílicas de Bouteloua gracilis y su caracterización in silico
| Autor: | Perla Lucía Ordóñez-Baquera, Everardo González Rodríguez, Gerardo Armando Aguado Santacruz, Quintín Rascón Cruz, Eduviges Burrola Barraza |
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| Jazyk: | English<br />Spanish; Castilian |
| Rok vydání: | 2016 |
| Předmět: | |
| Zdroj: | Revista Mexicana de Ciencias Pecuarias, Vol 7, Iss 3, Pp 263-274 (2016) |
| Druh dokumentu: | article |
| ISSN: | 2007-1124 2448-6698 |
| DOI: | 10.22319/rmcp.v7i3.4209 |
| Popis: | Bouteloua gracilis es un pasto nativo del norte de México, que es utilizado como fuente de forraje para el ganado por su alto contenido nutritivo; tiene elevada tolerancia al estrés osmótico que le permite vivir en climas secos; sin embargo, los mecanismos moleculares que le confieren esta tolerancia aún no se han reportado. Existe una clase de RNAs pequeños (sRNAs) llamados microRNAs (miRNAs), que se unen por complementariedad a RNAs mensajeros blanco, etiquetándolos para su degradación o supresión de la traducción. En este trabajo se reporta el aislamiento de sRNAs de B. gracilis, a través de la clonación de concatámeros y su secuenciación. El análisis in silico de la secuencias, permitió la identificación de miRNAs conservados en B. gracilis y reportados en Populus trichocarpa, Brachypodium distachyon, Oryza sativa, Sorghum bicolor, Zea mays, Malus domestica y Linum usitatissimum. Además, se predijo la estructura secundaria de los precursores de dos miRNAs (pre-miRNAs), usando como referencia los genomas de Glycine max, Zea mays, Sorghum bicolor y Oryza sativa. Finalmente, se identificaron seis mRNAs blanco para uno de ellos. La identificación de miRNAs en Bouteloua gracilis, ayudará a comprender como estas moléculas regulan la expresión genética en esta especie, y sus relaciones con los mecanismos de respuesta a estrés ambiental. |
| Databáze: | Directory of Open Access Journals |
| Externí odkaz: |
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