A validated lineage-derived somatic truth data set enables benchmarking in cancer genome analysis

Autor:	Megan Shand, Jose Soto, Lee Lichtenstein, David Benjamin, Yossi Farjoun, Yehuda Brody, Yosef Maruvka, Paul C. Blainey, Eric Banks
Jazyk:	angličtina
Rok vydání:	2020
Předmět:	Biology (General) QH301-705.5
Zdroj:	Communications Biology, Vol 3, Iss 1, Pp 1-8 (2020)
Druh dokumentu:	article
ISSN:	2399-3642
DOI:	10.1038/s42003-020-01460-9
Popis:	Megan Shand et al. present Lineage derived Somatic Truth (LinST), a validated data set of somatic mutations from a colon cancer cell line with a known lineage tree structure. They show that LinST can be used to benchmark true-positive and false-positive rates in somatic variant-calling pipelines applied to cancer genomic data.
Databáze:	Directory of Open Access Journals
Externí odkaz:	https://doaj.org/article/ac5e932b4eb24213a2667a14bb688207 Zobrazit plný text záznamu View record in DOAJ Plný text ve formátu PDF Plný text ve formátu HTML
Nepřihlášeným uživatelům se plný text nezobrazuje	K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.