Análisis bioinformático y predicción de genes en secuencias genómicas de Clostridium sp. IBUN22A
| Autor: | José David Montoya Solano, Zulma Rocío Suárez Moreno, Dolly Montoya Castaño, Fabio Ancízar Aristizábal Gutiérrez |
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| Jazyk: | Spanish; Castilian |
| Rok vydání: | 2006 |
| Předmět: | |
| Zdroj: | Revista Colombiana de Biotecnología, Vol 8, Iss 1 (2006) |
| Druh dokumentu: | article |
| ISSN: | 0123-3475 1909-8758 |
| Popis: | Este trabajo tuvo como propósito identificar secuencias de genes en clones obtenidos en una librería genómica de la cepa colombiana de Clostridium sp. IBUN 22A. Los insertos de nueve clones con tamaæos superiores a 500 pb fueron secuenciados y analizados por medio de bÅ“squedas de los insertos completos o de sus marcos abiertos de lectura (ORFs) traducidos en GenBank 141.0 y Uniprot 6.6 con BLAST 2.2.8. Se identificaron seis genes con alta similaridad a genes de metabolismo bÆsico (housekeeping) en diferentes especies de Clostridium. En el clon pBsIBUN22A-1 se localizó una secuencia de 851 pb con una identidad del 99.74% respecto al gen codificante de la enzima glicerol deshidratasa (DhaBl) de Clostridium butyricum (AY968605) involucrada en la producción de 1,3 Propanodiol (1,3-PD). La identificación de genes presentes en la cepa nativa Clostridium IBUN 22A abre la puerta a la investigación básica y a la ingeniería metabólica para hacer más rentable el proceso de producción de 1,3-PD junto al conocimiento de los genes presentes en la cepa nativa. Palabras clave: análisis de secuencias, librería genómica, Clostridium, glicerol deshidratasa, 1,3-propanodiol. |
| Databáze: | Directory of Open Access Journals |
| Externí odkaz: |
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