RAPD-PCR typing of Yersinia enterocolitica (Enterobacteriaceae) O:3 serotype strains isolated from pigs and humans
| Autor: | Tereza Cristina A. Leal, Nilma C. Leal, Alzira M. Paiva de Almeida |
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| Jazyk: | angličtina |
| Rok vydání: | 1999 |
| Předmět: | |
| Zdroj: | Genetics and Molecular Biology, Vol 22, Iss 3, Pp 315-319 (1999) |
| Druh dokumentu: | article |
| ISSN: | 1415-4757 1678-4685 |
| DOI: | 10.1590/S1415-47571999000300005 |
| Popis: | Sixteen strains of Yersinia enterocolitica serotype O:3, isolated from apparently healthy pigs collected in Rio de Janeiro, and four human strains of serotypes O:4, O:5, O:6 and O:13 were analyzed by RAPD-PCR. The strains were grouped into five genotypic profiles according to the amplification patterns obtained with three random primers. Fifteen of the 16 pig strains had identical amplification patterns, which was named genotypic profile 1. The one different profile was named genotypic profile 2. Genotypic profile 1 was also exhibited by the O:6 human serotype strain. The O:4 and O:13 human serotype strains showed similar amplification profiles with two primers. However, the third primer induced a distinct profile in each strain. Therefore, these two strains were placed into genotypic profile 3 and 4, respectively. Each primer produced a completely different amplification profile in the O:5 human serotype strain; therefore, it was named genotypic profile 5. The presence or absence of plasmids in the strains studied did not affect the amplification results. These results show that genetic variations can exist within a serotype, and strains of different serotypes can exhibit the same amplification profile when compared using other primers.Foram utilizados três "primers" aleatórios para caracterizar pela técnica RAPD-PCR 16 cepas de Yersinia enterocolitica do sorotipo O:3, isoladas de suínos sadios do Rio de Janeiro. Pelos resultados dos padrões de amplificação, as 16 cepas dos suínos e as 4 cepas humanas usadas como referência (sorotipos O:4, O:5, O:6 e O:13) foram agrupadas em 5 perfis genotípicos. Quinze cepas de suínos apresentaram um padrão de amplificação idêntico (perfil genotípico 1) e somente uma apresentou um perfil de amplificação diferente (perfil genotípico 2). O mesmo padrão de amplificação do perfil genotípico 1 foi também observado em uma cepa humana do sorotipo O:6. As cepas humanas dos sorotipos O:4 e O:13 exibiram perfis de amplificação semelhantes com 2 "primers", porém com o terceiro "primer" cada uma apresentou um perfil próprio. Essas duas cepas foram enquadradas, cada uma, em um tipo de perfil (perfis genotípicos 3 e 4, respectivamente). A cepa humana do sorotipo O:5 apresentou um perfil de amplificação com cada "primer" completamente diferente dos observados nas outras cepas (perfil genotípico 5). A presença ou ausência de plasmídios nas cepas estudadas não interferiu nos resultados das amplificações. Esses resultados mostram que dentro de um mesmo sorotipo podem existir modificações genéticas e que cepas de sorotipos diferentes apresentam o mesmo perfil de amplificação com alguns "primers", comprovando que o RAPD-PCR é uma ferramenta eficaz para reagrupamento de cepas e poderá ser útil em estudos epidemiológicos para rastreamento de uma cepa e assim acompanhar a disseminação de Y. enterocolitica. |
| Databáze: | Directory of Open Access Journals |
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