Relación genética entre las enfermedades pulmonares de origen ambiental u ocupacional y la osteoporosis: un enfoque bioinformático
| Autor: | Andújar-Vera F, García-Fontana C, González-Salvatierra S, Martínez-Heredia L, Muñoz-Torres M, García-Fontana B |
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| Jazyk: | English<br />Spanish; Castilian |
| Rok vydání: | 2021 |
| Předmět: | |
| Zdroj: | Revista de Osteoporosis y Metabolismo Mineral, Vol 13, Iss 4, Pp 130-136 (2021) |
| Druh dokumentu: | article |
| ISSN: | 1889-836X 2173-2345 |
| DOI: | 10.4321/S1889-836X2021000300005 |
| Popis: | Objetivos: Identificación de biomarcadores que relacionan la osteoporosis con enfermedades pulmonares ocupacionales y ambientales. Material y métodos: Mediante bases de datos de terminología médica unificada se obtuvieron enfermedades relacionadas con enfermedades pulmonares que, junto con la osteoporosis, fueron analizadas en DisGeNET para obtener los genes asociados a cada enfermedad y formar una red de interacción proteína-proteína (PPI) mediante el uso de STRING dentro de Cytoscape. A través de la aplicación de diferentes algoritmos de centralidad utilizando CythoHubba en Cytoscape, se seleccionaron las 5 proteínas de la red con el mayor grado de centralidad. Resultados: 9 enfermedades fueron incluidas en el grupo de enfermedades pulmonares. Se obtuvieron 2.698 genes asociados a enfermedades pulmonares y a osteoporosis. Los genes vinculados con osteoporosis y con al menos dos de las enfermedades pulmonares incluidas dieron lugar a una red PPI con 152 nodos y 1.378 ejes. Las proteínas con mayor grado de centralidad de la red fueron AKT1, ALB, IL6, TP53 y VEGFA. Conclusiones: Existe una elevada relación entre la osteoporosis y las enfermedades pulmonares ambientales estudiadas, a través de genes con una implicación dual. Nosotros proponemos cinco genes importantes que vinculan estas enfermedades y que podrían constituir una base coherente para investigaciones más profundas en este campo. |
| Databáze: | Directory of Open Access Journals |
| Externí odkaz: |
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