Genome-wide identification and expression analysis of Dimocarpus longan UBP family and its expression analysis under drought stress(龙眼UBP家族全基因组鉴定及其在外源胁迫下的表达分析)

Autor: 童宁(TONG Ning)
Jazyk: čínština
Rok vydání: 2023
Předmět:
Zdroj: Zhejiang Daxue xuebao. Lixue ban, Vol 50, Iss 3, Pp 367-377 (2023)
Druh dokumentu: article
ISSN: 1008-9497
DOI: 10.3785/j.issn.1008-9497.2023.03.015
Popis: 泛素特异蛋白酶(ubiquitin-specific protease,UBP)是去泛素化酶六大家族中最大的,广泛存在于真核生物中,保守性很高。UBP可通过去泛素化作用调节各种生物的生长发育。为了解龙眼(Dimocarpus longan Lour.)DlUBP基因家族的生物学功能及其在龙眼体胚早期发生过程中的作用,基于第3代龙眼基因组数据库与转录组数据库,对DlUBP全基因组进行鉴定,分析其基因结构、蛋白质结构域、启动子顺式元件及构建系统进化树,并对DlUBP基因在脱落酸处理和干旱胁迫处理下的表达情况进行分析。结果显示,DlUBP家族共有18个成员,分为10个亚家族,其中最大的亚家族有4个成员;各成员的氨基酸数为369~1 117个,内含子数为2~31个;在DlUBP启动子序列中存在大量光响应元件、厌氧诱导响应元件、激素响应元件,随着处理时间的增加,在脱落酸处理下,多数DlUBP基因的表达量呈降低趋势,在干旱胁迫处理下,有不少DlUBP基因的表达量升高,推测DlUBP基因在龙眼体胚早期参与脱落酸的调控并对干旱胁迫有应激反应。
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