Determination of hepatitis C virus genotype distribution in Adıyaman province
| Autor: | Akgün, Sadık, Tarhan, Gülnur, Sayıner, Hakan Sezgin, AKGÜN, İlkay, KÖK, Selçuk |
|---|---|
| Rok vydání: | 2016 |
| Předmět: | |
| Zdroj: | Volume: 9, Issue: 1 1-5 Ortadoğu Tıp Dergisi |
| ISSN: | 2548-0251 |
| Popis: | Amaç:Hepatit C virus (HCV) enfeksiyonuTürkiye’de ve dünyada en önemli karaciğer hastalıklarından biridir. HCV yüksekdüzeyde genetik heterojenite göstermektedir. Tüm dünyada şimdiye kadar altımajör tipi ve çok sayıda alt tipi tanımlanmıştır. Dünyanın farklıbölgelerinde HCV genotipleri ve alttiplerinin dağılımı değişmektedir. Bu çalışmanın amacı Adıyaman ilinde kronik HCV enfeksiyonlu hastalarda HCVgenotip dağılımını belirlemektir.Materyal ve Metod:Bu çalışmada kronik HCV enfeksiyonlu 71 (26 kadın, 45 erkek) hastadeğerlendirildi. Viral genotipler dizi analizi (ABI Prism 310 Genetic Analyzer) ve HCV-RNA Real Time PCRgenotipleme performans paneli (PHW 202, BBI Diagnostics) ile üreticifirmanın önerilerine göre çalışılarak belirlendi. Bulgular: 71 hastanın 51’inde (%71,83) genotip 1bgözlendi. HCV-RNA pozitif olan örneklerin geri kalanında; 6 hastada genotip 1a (%8,45) ve 8’inde (%11,27) genotip2b enfeksiyonu gösterildi. Geri kalan 6örneğin 3’ünde (%4,22) genotip 1 ve 3’ünde (%4,22) genotip 3a olarak tespit edildi. Genotip ve ya alt tip dağılımıbakımından kadın ve erkek cinsiyet yönünden istatistiksel olarak anlamlı birfark gözlenmedi.Sonuç:Sonuçlarımıza göre genotip 1b Adıyaman ilinde baskın olarak saptandı. Ancak zamanla diğer genotiplerindeortaya çıktığıgösterilmiştir. Aim: Hepatitis C Virus (HCV) infection is oneof the most important liver diseases in Turkey and worldwide.HCV shows high degree of genetic heterogeneity; consequently six majorgenotypes and multiple subtypes of HCV have been identified so far in world.Distribution of HCV genotypes and subtypes in different regions of the world isvariable. The objective of this study was to determine the distribution ofgenotypes of hepatitis C virus in patients with chronic hepatitis C infectionin Adıyaman province.Material and Method: Serum samples from 71 patients (26 female, 45male) with chronic HCV infection were analyzedin this study. Viral genotypes were determined by using squences analysis (ABI Prism 310 Genetic Analyzer)and HCV-RNA Real Time PCR genotyping performance panel(PHW 202, BBI Diagnostics) workingaccording to the manufacturer’s instructions.Results: Genotype 1b was observed in 51 of the 71 patients (71.83%). The remainder ofHCV-RNA positive specimens; In 6 patient was showed infection with subtype 1a (8.45%) and 8 with subtype 2b (11.27%).The rest of 6 specimen were determined genotype 1 and subtip 3a as 4.22%. There were no statistical differencesbetween female and male patients groups for distrubition of genotype orsubtype.Conclusion: Accordingto our results, we found genotype 1b was dominant in Adiyaman province ofTurkey. Our results were similar with others performed in this area. Inaddition, dominant HCV genotype was 1b; however, the other genotypes have beenincreasingly determined. |
| Databáze: | OpenAIRE |
| Externí odkaz: |
|