Wistar Irkı Ratlardan İzole Edilen Escherichia Coli’lerin Filogenetik Analizi

Autor: MÜŞTAK, H. Kaan, TORUN, Ebru, KAYA, İnci Başak, KAYA, Elif Ergüven, DİKER, Şeyda, ANADOL, Elvan, GÜNAYDIN, Elçin
Jazyk: turečtina
Rok vydání: 2013
Předmět:
Zdroj: Volume: 24, Issue: 2 60-63
Etlik Veteriner Mikrobiyoloji Dergisi
ISSN: 1016-3573
2717-8099
Popis: It is already known that several bacterial agents can be transmitted from rats (Rattus spp.) that live in naturalhabitats to human beings and susceptible animals. Escherichia coli (E.coli) which cause systemic diseases in humansand naturally found in rats like other mammalians are important zoonotic agents. Nevertheless, there are few reports onrats which are used as laboratory animal. Like other animal species, it is important to know phenotypic and genotypicfeatures of E.coli isolated from laboratory animals in order to prevent infections due to E.coli. In this study the presenceof E.coli isolated from faeces of Wistar rats and the phylogeny of these strains were investigated. For this purpose, 61E.coli strains isolated from faeces of 112 rats were investigated for the presence of chuA, yjaA, arpA and trpA genes anda DNA fragment known as TspE4.C2, by PCR. The results showed that 43/61 (70.4%) and 18/61 (29.5%) strains belongto B1 (commensal) and B2 (extraintestinal) groups, respectively. For the first time in this study E.coli isolated from ratswere phylogrouped, assigned as B1 group and designated as commensal E.coli in Turkey.
Doğal ortamlarında yaşayan ratlardan (Rattus spp.), insanlara ve duyarlı hayvanlara birçok hastalık etkeniningeçtiği bilinmektedir. İnsanlarda önemli sistemik hastalıklara yol açan ve diğer memeli hayvanlar gibi ratların da doğalkonakçısı olduğu bilinen Escherichia coli ( E.coli), önemli bir zoonotik etkendir. Ancak laboratuvar hayvanı olarakkullanılan ratlar ile ilgili özellikle ülkemizde yeterli veri bulunmamaktadır. Diğer hayvan türlerinde olduğu gibi laboratuvarortamında yetiştirilen ratlardan da izole edilen E.coli’lerin genotipik ve fenotipik özelliklerinin bilinmesi, E.colikökenli enfeksiyonların önlenmesinde önemlidir. Bu çalışmada, deney hayvanı olarak kullanılan Wistar ırkı ratlardanelde edilen fekal örneklerde E.coli varlığı ve izole edilen E.coli’lerin dahil oldukları filogenetik gruplar araştırılmıştır.Bu amaçla, 112 rattan toplanan dışkıdan klasik kültür yöntemiyle izole edilen 61 E.coli suşuna, chuA, yjaA, arpA vetrpA genlerine ve TspE4.C2 DNA fragmentine, spesifik primerlerin kullanıldığı PCR yöntemi uygulandı. Elde edilensonuçlara göre 43/61 (%70.4) suş B1 grubuna (kommensal), 18/61 (%29.5) suş ise B2 grubuna (ekstraintestinal) dahilolarak bulundu. Yapılan bu çalışma ile Türkiye’de ilk kez ratlardan izole edilen E.coli’lerin filogrup analizleri yapılarak,ağırlıklı olarak B1 grubunda yer aldıkları ve kommensal özellikte oldukları saptandı.
Databáze: OpenAIRE
Externí odkaz: