Detection of Fungi in Cooling Tower Samples Using Fluorescent In Situ Hybridization and Traditional Culture-Dependent Methods
| Autor: | Kadaifçiler, Duygu, Zeybek, Zuhal |
|---|---|
| Rok vydání: | 2017 |
| Předmět: | |
| Zdroj: | Volume: 8, Issue: 1 68-75 Mantar Dergisi |
| ISSN: | 2147-6845 |
| Popis: | Doğada ve insan yapımısu sistemlerinde yaygın olarak bulunan Eurotiales üyesi fungusların varlığının tespiti, fırsatçı enfeksiyon vealerjilere yol açabilen bu funguslara karşı alınabilecek önlemler açısındanönemlidir. Bu çalışmada soğutma kulesi örneklerindeki fungusların varlığı, hemfloresanlı yerinde hibritleme (FISH) hem de kültür yöntemiyle araştırılmış, heriki yöntemin sonuçları karşılaştırılmıştır. Bu amaçla İstanbul’daki farklısoğutma kulelerine ait toplam 40 adet su ve biyofilm örnekleri alınarakincelenmiştir. Kültür yönteminde tüm örnekler, ön işlemlerden sonra izolasyonbesiyerine ekilmiştir. Ekimlerin sonuçları 14 gün sonunda değerlendirilmiştir.FISH yönteminde ise; tüm örnekler fikse edilip uygun problar kullanılarakhibridizasyonu yapıldıktan sonra epifloresan mikroskopta incelenmiştir. FISHyöntemi ile 3 gün gibi kısa bir sürede sonuç elde edilmiştir. Ayrıca bu yöntem ile incelenen örneklerin tamamında, kültür yönteminde ise incelenen örneklerin%97.5’in de fungus tespit edilmiştir. Kültür yöntemi ile en çok izole edilenfungusların Aspergillus ve Penicillium cinsine ait olduklarıbelirlenmiştir. Çalışma sonucunda her iki yöntemin beraber kullanılmasıönerilmektedir. Thedetermination of the presence of Eurotiales members, which are widelydistributed in nature and in man-made aquatic systems, is important for takingmeasures against those capable of creating opportunistic infections andallergies. In this study, the presence of fungi in cooling-tower samples was determinedby using two different methods, one being fluorescent in situ hybridization(FISH), the second culturing; both sets of results were compared with eachother. For this purpose, a total of 40 water and biofilm samples were takenfrom different cooling towers in Istanbul for investigation. In the culturemethod, all samples were applied to the isolation medium after pretreatment.The results of the applications were evaluated after 14 days. With the FISHmethod, all samples were fixed and hybridized by using suitable probes and wereinvestigated under an epifluorescent microscope. Results were obtained after ashort period of three days. The FISH method was able to detect 100% of fungi inall samples, whereas the culture method was able to detect 97.5% of the fungiin the samples. With culture method, the most isolated fungi were from the Aspergillus and Penicillium genera. As a result of the study, both methods arerecommended to be used in conjunction. |
| Databáze: | OpenAIRE |
| Externí odkaz: |
|