Investigation of The Agents of Viral Gastroenteritis by PCR İn Stool Specimens with Rota/Adenovirus Positive by Antigen Test

Autor: KIRDAR, Sevin, KAHYAOĞLU, Fadime, YAZICI, Vesile, AYDIN, Neriman
Jazyk: turečtina
Rok vydání: 2017
Předmět:
Zdroj: Volume: 1, Issue: 3 88-93
Journal of Biotechnology and Strategic Health Research
ISSN: 2587-1641
Popis: Giriş: Akut gastroenterit, tüm dünyada oldukça sık görülen önemli bir halk sağlığı sorunudur. Özellikle çocukluk çağında görülmekle birlikte tüm yaş grupları etkilenebilmektedir. Akut gastroenterite en sık neden olan viral patojenler arasında rotavirus, kalisiviruslar (norovirus ve sapovirus), enterik adenoviruslar (adenovirus 40, 41) astrovirus ve bocavirus bulunmaktadır. Bu çalışmada, akut gastroenteritli hastalarda immünokromatografik yöntem ile rotavirus ve adenovirus pozitif belirlenen dışkı örneklerde polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) ile olası viral etkenlerin araştırılması amaçlanmıştır. Materyal ve Metod: Bu çalışmaya Aydın Adnan Menderes Üniversitesi Tıp Fakültesi ve Kocaeli Derince Eğitim ve Araştırma Hastanesi Tıbbi Mikrobiyoloji Laboratuvarı’na Ocak-Aralık 2013 döneminde akut gastroenterit ön tanılı hastalardan gönderilen ve Rota- Adeno antijen testi (Laboquick, İzmir, Türkiye) çalışılan toplam 502 dışkı örneğinden rotavirus ve adenovirus pozitif bulunan 80 örnek dahil edilmiştir. Bu 80 örnekte rotavirus, norovirüs, astrovirüs ve adenovirüs Seeplex® Diarrhea ACE Detection multiplex PZR system (Seeplex system; Seegene, Korea) kiti ile multipleks PZR ve bocavirusa özgül primerlerin kullanıldığı in-house PZR yöntemleri ile araştırılmıştır. Bulgular: Bu çalışmada bir yıllık sürede akut gastroenterit ön tanısıyla gelen toplam 502 hastaya ait dışkı örneğinin 80’inde (15.9) antijen testi ile pozitiflik bulunmuştur. Antijen testi ile pozitif 80 dışkı örneğinin 74 (%92.5)’ ü rotavirus ve 6 (% 7.5)’sı adenovirus pozitif dışkı örnekleriydi. Bu örneklerden multipleks PZR ile 72 (%90) rotavirus, 6 (%7.5) norovirus belirlenmiş, astrovirus ve adenovirus ise bulunmamıştır. Bocavirusa özgül PZR ile 2 (%2.5) örnekte bocavirus belirlenmiştir. Dışkı örneklerinin 6’sında rotavirus ve norovirus birlikte, 2 örnekte ise rotavirus ve bocavirus birlikte pozitif bulunmuştur. Tartışma ve Sonuç: Akut gastroenterit ön tanısı ile gelen hastalarda rotavirus ve adenovirus tanısı için antijen testinin uygun olduğu düşünülmektedir. Ancak epidemiyolojik veriler oluşturmak için PZR ile diğer viral etkenlerin de tanımlanması gerekmektedir.
Background: Acute gastroenteritis is an important public health problem that is very common all over the world, affecting all age groups, especially in childhood. Viral pathogens causing acute gastroenteritis include rotavirus, norovirus, sapovirus, adenovirus, astrovirus. and bocavirus. In this study, it was aimed to investigate possible viral agents by polymerase chain reaction (PCR) in stool specimens with positive rotavirus and adenovirus by immunochromatographic method in patients with acute gastroenteritis. Materials and Methods: Between January and December of 2013, a total 502 stool samples collected from patients diagnosed with acute gastroenteritis were admitted in Research and Education Hospitals of Adnan Menderes University and Kocaeli Derince were included and Only 80 samples were detected rotavirus ve adenovirus positive with Rota-Adeno antigen test (Laboquick, İzmir, Türkiye) were analyzed further. Rotavirus, norovirus, astrovirus and adenovirus were investigated using the Seeplex® Diarrhea ACE Detection multiplex PCR system (Seeplex system; Seegene, Korea) and bocavirus presence was determined using in-house PCR in 80 samples. Results: In this study, 80 (15.9) of stool specimens from a total of 502 patients who were diagnosed with acute gastroenteritis for one year were found to be positive by antigen test. Of 80 samples were positive 74 (92.5%) rotavirus and 6 (7.5%) adenovirus. In these samples, 72 (90%) rotavirus and 6 (7.5%) norovirus were detected by multiplex PZR and 2 (2.5%) bocavirus by specific PZR, whereas no astrovirus and adenovirus were found. Rotavirus and norovirus were found together in 6 of stool specimens and rotavirus and bocavirus were found together in 2 samples. Discussion and Conclusion: Antigen test for rotavirus and adenovirus diagnosis is considered appropriate in patients with acute gastroenteritis. However, it is necessary to identify other viral agents with PCR to generate epidemiological data.
Databáze: OpenAIRE
Externí odkaz: