Autosomal and Mitochondrial Adaptation Following Admixture: A Case Study on the Honeybees of Reunion Island

Autor: Wragg, David, Técher, Maéva Angélique, Canale-Tabet, Kamila, Basso, Benjamin, Bidanel, Jean Pierre, Labarthe, Emmanuelle, Bouchez, Olivier, Le Conte, Yves, Clémencet, Johanna, Delatte, Hélène, Vignal, Alain
Přispěvatelé: Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT], Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Peuplements végétaux et bioagresseurs en milieu tropical (UMR PVBMT), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de La Réunion (UR), Université de La Réunion (UR), Ecology and Evolution Unit, Okinawa Institute of Science and Technology (OIST), Roslin Institute, University of Edinburgh, UMT Prade, Institut Technique et Scientifique de l'Apiculture et de la Pollinisation (ITSAP-Institut de l'Abeille), Association de Coordination Technique Agricole (ACTA), Association pour le Développement de l'Apiculture Provençale (ADAPI), Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Université Paris-Saclay, GeT PlaGe, Genotoul, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Abeilles et Environnement (AE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Avignon Université (AU), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Okinawa Institute of Science and Technology Graduate University (OIST), UR 406 Abeilles & Environnement, France AgriMer, Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse (ENSAT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT), Université de Toulouse (UT), The Roslin Institute, Biotechnology and Biological Sciences Research Council (BBSRC), UMT Protection des abeilles dans l’environnement (UMT PrADE), Association pour le Developpement de l'Apiculture Provencale (ADAPI)-Institut de l'abeille (ITSAP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Terres Inovia-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Les instituts techniques agricoles (Acta), Association pour le Developpement de l'Apiculture Provencale (ADAPI), Génome et Transcriptome - Plateforme Génomique (GeT-PlaGe), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Plateforme Génome & Transcriptome (GET), Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), GenPhySE - UMR 1388 ( Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-ENVT, Institut National Polytechnique de Toulouse ( INPT ), Université de Toulouse, UMR PVBMT, Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement ( CIRAD ), Université de la Réunion ( UR ), Institut Technique et Scientifique de l'Apiculture et de la Pollinisation ( ITSAP-Institut de l'Abeille ), Association de Coordination Technique Agricole, Association pour le Développement de l'Apiculture Provençale ( ADAPI ), Génétique Animale et Biologie Intégrative ( GABI ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech, Université Paris Saclay, Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Abeilles et Environnement ( AE ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université d'Avignon et des Pays de Vaucluse ( UAPV ), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3)
Jazyk: angličtina
Rok vydání: 2017
Předmět:
Male
Acclimatization
[SDV]Life Sciences [q-bio]
Genome
Insect
Évolution
adaptation
Apis mellifera mellifera
Génétique des populations
Apis mellifera scutellata
Marqueur génétique
insects
Introduction d'animaux
Genomics
Bees
Mitochondrie
Adaptation
Physiological
Mitochondria
[SDE]Environmental Sciences
Female
Apis mellifera
Apis mellifera ligustica
Research Article
Zone tropicale
Apis mellifera carnica
Séquence nucléotidique
DNA
Mitochondrial
Molecular Evolution
genomics/proteomics
Genetics
Animals
[INFO]Computer Science [cs]
Adaptation
insect
molecular evolution
[SDV.GEN]Life Sciences [q-bio]/Genetics
Génome
[ SDV ] Life Sciences [q-bio]
L60 - Taxonomie et géographie animales
L10 - Génétique et amélioration des animaux
[SDV.GEN.GA]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Animal genetics
Genome
Mitochondrial
Reunion
Zdroj: Genome Biology and Evolution
Genome Biology and Evolution, Society for Molecular Biology and Evolution, 2017, pp.220-238
Genome Biology and Evolution, Society for Molecular Biology and Evolution, 2017, 10 (1), pp.220-238. ⟨10.1093/gbe/evx247⟩
Genome Biology and Evolution 1 (10), 220-238. (2017)
Genome Biology and Evolution, 2017, 10 (1), pp.220-238. ⟨10.1093/gbe/evx247⟩
Wragg, D, Techer, M, Canale-Tabet, K, Basso, B, Bidanel, J-P, Labarthe, E, Bouchez, O, Le Conte, Y, Clemencet, J, Delatte, H & Vignal, A 2018, ' Autosomal and mitochondrial adaptation following admixture: a case study on the honeybees of Reunion Island. ', Genome Biology and Evolution, vol. 10, no. 1, pp. 220-238 . https://doi.org/10.1093/gbe/evx247
Genome Biology and Evolution 1 (10), 220–238. (2018)
ISSN: 1759-6653
DOI: 10.1093/gbe/evx247⟩
Popis: The honeybee population of the tropical Reunion Island is a genetic admixture of the Apis mellifera unicolor subspecies, originally described in Madagascar, and of European subspecies, mainly A. m. carnica and A. m. ligustica , regularly imported to the island since the late 19th century. We took advantage of this population to study genetic admixing of the tropical-adapted indigenous and temperate-adapted European genetic backgrounds. Whole genome sequencing of 30 workers and 6 males from Reunion, compared with samples from Europe, Madagascar, Mauritius, Rodrigues, and the Seychelles, revealed the Reunion honeybee population to be composed on an average of 53.2 6 5.9% A. m. unicolor nuclear genomic background, the rest being mainly composed of A. m. carnica andtoalesserextent A. m. ligustica . In striking contrast to this, only 1 out of the 36 honeybees from Reunion had a mitochondrial genome of European origin, suggesting selection has favored the A. m. unicolor mitotype, which is possibly better adapted to the island’s bioclimate. Local ancestry was determined along the chromosomes for all Reunion samples, and a test for preferential selection for the A. m. unicolor or European background revealed 15 regions significantly associated with the A. m. unicolor lineage and 9 regions with the European lineage. Our results provide insights into the long- term consequences of introducing exotic specimen on the nuclear and mitochondrial genomes of locally adapted populations
Databáze: OpenAIRE
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