Exploring the role of NCCR variation on JC polyomavirus expression from dual reporter minicircles
| Autor: | L’Honneur, Anne-Sophie, Leh, Hervé, Laurent-Tchenio, Fanny, Hazan, Uriel, Rozenberg, Flore, Bury-Moné, Stéphanie |
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| Přispěvatelé: | Service de Virologie [CHU Cochin], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Cochin [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Laboratoire de Biologie et de Pharmacologie Appliquée (LBPA), École normale supérieure - Cachan (ENS Cachan)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Département Microbiologie (Dpt Microbio), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Microbiologie Moléculaire des Actinomycètes (ACTINO), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Institut Cochin (UMR_S567 / UMR 8104), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hôpital Cochin [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Cochin [AP-HP], Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5) |
| Jazyk: | angličtina |
| Rok vydání: | 2018 |
| Předmět: |
Gene Expression Regulation
Viral MICROBIO Physiology Bioinformatics viruses [SDV]Life Sciences [q-bio] lcsh:Medicine Artificial Gene Amplification and Extension Genome Viral DNA construction Urine Transfection Research and Analysis Methods Nervous System Polymerase Chain Reaction Gene Types Untranslated Regions Cell Line Tumor Medicine and Health Sciences Genetics Point Mutation Humans Molecular Biology Techniques lcsh:Science Molecular Biology DNA sequence analysis Cerebrospinal Fluid Polyomavirus Infections Polymorphism Genetic Database and informatics methods lcsh:R Sequence analysis Leukoencephalopathy Progressive Multifocal Biology and Life Sciences virus diseases JC Virus Body Fluids HEK293 Cells Plasmid Construction Mutation ACTINO lcsh:Q Anatomy Research Article Reporter Genes |
| Zdroj: | PLoS ONE PLoS ONE, 2018, 13 (6), pp.e0199171. ⟨10.1371/journal.pone.0199171⟩ PLoS ONE, Public Library of Science, 2018, 13 (6), pp.e0199171. ⟨10.1371/journal.pone.0199171⟩ PLoS ONE, Vol 13, Iss 6, p e0199171 (2018) |
| ISSN: | 1932-6203 |
| DOI: | 10.1371/journal.pone.0199171⟩ |
| Popis: | JC virus (JCV), a ubiquitous human polyomavirus, can cause fatal progressive multifocal leukoencephalopathy (PML) in immune compromised patients. The viral genome is composed of two conserved coding regions separated by a highly variable non-coding control region (NCCR). We analyzed the NCCR sequence from 10 PML JCV strains and found new mutations. Remarkably, the NCCR f section was mutated in most cases. We therefore explored the importance of this section in JCV expression in renal (HEK293H) and glioblastoma (U-87MG) cell lines, by adapting the emerging technology of DNA minicircles. Using bidirectional fluorescent reporters, we revealed that impaired NCCR-driven late expression in glioblastoma cells was restored by a short deletion overlapping e and f sections. This study evidenced a relevant link between JCV NCCR polymorphism and cell-type dependent expression. The use of DNA minicircles opens new insights for monitoring the impact of NCCR variation. |
| Databáze: | OpenAIRE |
| Externí odkaz: |
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