Генетическая характеристика клинических изолятов клебсиелл, циркулирующих в Новосибирске
| Autor: | Bardasheva, A.V., Fomenko, N.V., Kalymbetova, T.V., Babkin, I.V., Chretien, S.O., Zhirakovskaya, E.V., Tikunova, N.V., Morozova, V.V. |
|---|---|
| Jazyk: | angličtina |
| Rok vydání: | 2021 |
| Předmět: |
диско-диффузионный анализ
фторхинолоны metallo-beta-lactamases металло-бета-лактамазы молекулярное серотипирование molecular serotyping extended-spectrum beta-lactamases fluoroquinolone бета-лактамы беталактамазы расширенного спектра аминогликозиды генетические детерминанты антибиотикорезистентности Klebsiella aminoglycoside Original Article beta-lactam disco-diffusion analysis genetic determinants of antibiotic resistance |
| Zdroj: | Vavilov Journal of Genetics and Breeding |
| ISSN: | 2500-3259 2500-0462 |
| Popis: | Проанализированы 72 клинических штамма Klebsiella spp., изолированных в Новосибирске из образцов, полученных от людей. Проведена видовая идентификация штаммов по последовательностям генов 16S рРНК и rpoB. Показано, что в популяции клебсиелл доминировали штаммы Klebsiella pneumoniaе (57 штаммов), остальные 15 штаммов относились к видам K. grimontii, K. aerogenes, K. oxytoca и K. quasipneumoniae. Методом молекулярного серотипирования с использованием последовательности гена wzi штаммы K. pneumoniae были отнесены к двадцати одному K-cеротипу, при этом большую долю составляли вирулентные серотипы K1 и K2. Выявлено, что штаммы K. pneumoniae, полученные от госпитализированных пациентов, обладали максимально выраженной резистентностью к различным классам антибиотиков в отличие от остальных видов клебсиелл. Методом ПЦР в реальном времени обнаружено, что в исследованной популяции присутствуют гены семейств blaSHV, blaTEM, blaCTX и ген blaOXA-48 , являющиеся генетическими детерминантами резистентности к бета-лактамам. Показано, что присутствие последовательности blaCTX коррелирует с продукцией штаммом бета-лактамаз расширенного спектра, а фенотипическая устойчивость к карбапенемам обусловлена наличием гена blaOXA-48 . При этом генов карбапенемаз vim, ndm, kpc, imp обнаружено не было. Cреди исследованных генов устойчивости к аминогликозидам были найдены гены aph(6)-Id и aadA, однако их наличие не всегда совпадало с фенотипической резистентностью. Устойчивость к фторхинолонам у большинства штаммов сопровождалась присутствием генов aac(6’)-Ib-cr, oqxA, oqxB, qnrB и qnrS в различных комбинациях, при этом наличие только генов oqxA и/или oqxB не коррелировало с устойчивостью к фторхинолонам. Таким образом, обнаружение blaCTX и blaOXA-48 может быть использовано для быстрого выявления продукции беталактамаз расширенного спектра и определения резистентности клебсиелл к карбапенемам, а выявление генов aac(6’)-Ib-cr и/или qnrB/qnrS – для быстрого определения устойчивости к фторхинолонам |
| Databáze: | OpenAIRE |
| Externí odkaz: |
|