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Une approche par gène candidats liés à la floraison chez 254 variétés de pommier cultivé (Malus domestica) et 88 de ses proches parents sauvages (Malus orientalis, Malus sieversii, Malus sylvestris, Malus baccata) nous a permis d'explorer la variation phénologique de la floraison en lien avec la domestication du pommier. Pour cela, nous disposons des dates de floraison sur quatre années et de 18 663 variants génétiques détectés sur les gènes de floraison des cinq espèces. L'étude des dates de floraison des espèces sauvages et cultivés a révélé que les pommiers sauvages fleurissent plus précocement que les pommiers cultivés. Avec le logiciel PCAdapt qui permet de détecter des signaux de sélection positive liés à l'adaptation locale, des variants génétiques ont été détectés chez le pommier cultivé, d'autres sont présents chez ses proches parents sauvages M. sieversii, M. orientalis et M. sylvestris. Ces découvertes apportent un nouvel aperçu du processus de domestication du pommier pour un des caractère phénotypique clé, la floraison. |
