Calculating autoecological data (optima and tolerance range) for multiple species with the ‘optimos.prime’ R package

Autor: Sathicq, María Belén, Nicolosi Gelis, María Mercedes, Cochero, Joaquin
Jazyk: angličtina
Rok vydání: 2020
Předmět:
Popis: The calculation of autoecological data, such as optima and tolerance ranges to environmental variables, can be useful to establish the distribution and abundance of the species. These calculations, although mathematically not complex, can be prone to error when using a large database. We show how to calculate the optimum value and tolerance ranges of multiple species to multiple environmental factors in a single run, by weighted average using a specific R package (?optimos.prime?). Using sample data from a phytoplankton database, we exemplify the use of the R package and its functions. A stand‐alone version for Windows is also provided, and source code and documents are freely available on GitHub to encourage collaborative work. Fil: Sathicq, María Belén. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Limnología "Dr. Raúl A. Ringuelet". Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Naturales y Museo. Instituto de Limnología; Argentina. Universidad Nacional de La Plata; Argentina. Instituto Di Riecerca Sulle Acque; Italia Fil: Nicolosi Gelis, María Mercedes. Universidad Nacional de La Plata; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Limnología "Dr. Raúl A. Ringuelet". Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Naturales y Museo. Instituto de Limnología; Argentina Fil: Cochero, Joaquin. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Limnología "Dr. Raúl A. Ringuelet". Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Naturales y Museo. Instituto de Limnología; Argentina. Universidad Nacional de La Plata; Argentina
Databáze: OpenAIRE