Identification of Expression alteration of Pseudogenes and Their Corresponding Parental Genes in Pulmonary Adenocarcinoma

Autor: Lapa, Rainer M.L.
Přispěvatelé: Universidade Estadual Paulista (Unesp), Reis, Patricia Pintor dos [UNESP]
Jazyk: portugalština
Rok vydání: 2019
Předmět:
Zdroj: Repositório Institucional da UNESP
Universidade Estadual Paulista (UNESP)
instacron:UNESP
Popis: Submitted by RAINER MARCO LOPEZ LAPA (reimco2@gmail.com) on 2019-04-23T23:29:50Z No. of bitstreams: 1 Rainer_Lopez_Tese_Doutorado.pdf: 7605148 bytes, checksum: bbed15f282f29d859ff24940f01c5ce9 (MD5) Approved for entry into archive by ROSANGELA APARECIDA LOBO null (rosangelalobo@btu.unesp.br) on 2019-04-25T18:06:46Z (GMT) No. of bitstreams: 1 lapa_rml_dr_bot_par.pdf: 721062 bytes, checksum: c1d9177c0e1f8a154991b7f533d5cb9b (MD5) Made available in DSpace on 2019-04-25T18:06:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 lapa_rml_dr_bot_par.pdf: 721062 bytes, checksum: c1d9177c0e1f8a154991b7f533d5cb9b (MD5) Previous issue date: 2019-02-27 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) Introdução: O adenocarcinoma é o subtipo histológico mais comum de câncer de pulmão e leva à óbito milhões de pacientes a cada ano, mundialmente. Biomarcadores com utilidade clínica potencial têm sido identificados; entre estes, os RNAs não codificadores e os pseudogenes apresentam um potente papel na regulação de genes-alvo e genes parentais regulados por mRNAs respectivamente, os quais estão associados a vias moleculares de tumorigênese. Objetivos: Identificar alterações na expressão de pseudogenes em adenocarcinoma pulmonar, utilizando dados de transcritoma (RNA-Seq). Material e Métodos: Este estudo incluiu 27 tumores de adenocarcinoma pulmonar e 10 tecidos pulmonares histologicamente normais, adjacentes ao tumor, dos mesmos pacientes. Dados de RNA-Seq foram gerados na plataforma Illumina HiScan SQ e utilizados para a aplicação de uma estratégia de análise a fim de identificar sequências de pseudogenes com expressão anormal em tumores. Os pseudogenes com expressão significativamente alterada (p1 million), every year. Clinically useful biomarkers have been identified; among these, non-coding RNAs and pseudogenes have a potent role in the regulation of miRNA target genes and parental genes, respectively, which are associated with tumorigenesis pathways. Objectives: To identify alterations in pseudogene expression in lung adenocarcinoma using transcriptome data (RNA-Seq). Material and Methods: This study included 27 lung adenocarcinoma and 10 histologically normal tissues, adjacent to the tumors, from the same patients. RNA-Seq data were generated on the Illumina HiScan SQ platform and utilized for application of a data analysis strategy (pipeline) in order to identify pseudogene sequences with abnormal expression in tumor compare to normal tissues. Pseudogenes with significantly altered expression (p
Databáze: OpenAIRE
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