HLA in Jaidukama: an Amerindian secluded Colombian population with new haplotypes and Asian and Pacific-shared alleles

Autor: Martínez Laso, Jorge, Montoya, Luisa Fernanda, Areces, Carlos, Moscoso, Joana, Silvera, C, Rey, Diego Ariel, Parga Lozano, Carlos, Gómez Prieto, Pedro, Enríquez de Salamanca, M, Arnaiz Villena, Antonio
Jazyk: angličtina
Rok vydání: 2022
Zdroj: Repositorio Institucional U. Caldas
Universidad de Caldas
instacron:Universidad de Caldas
Popis: spa: Los primeros habitantes y el poblamiento de América todavía se debaten. Para aumentar el conocimiento sobre estas cuestiones, nos hemos propuesto detectar genes HLA de una comunidad amerindia aislada: Jaidukama, que vive en la selva ecuatorial del norte de Colombia. Se realizaron cálculos de genotipado HLA y haplotipo extendido en 39 individuos sanos pertenecientes a 13 familias. Las frecuencias de HLA se compararon con otras poblaciones amerindias y de todo el mundo mediante el cálculo de distancias genéticas, dendrogramas de parentesco y análisis de correspondencia. Solo se encontraron cuatro alelos DRB1 (*0404, *0407, *1402 y *1602); sin embargo, se contaron directamente un total de 17 haplotipos HLA de clase I-clase II amerindios diferentes a partir de los estudios familiares, nueve de ellos eran específicos de Jaidukamas. Algunos de los alelos o grupo de alelos dentro de un haplotipo extendido (es decir, DQB1–DRB1) también se encontraron en asiáticos e isleños del Pacífico, lo que respalda aún más la existencia de un flujo de genes asiáticos y del Pacífico con amerindios o un efecto fundador común. Se apoya además que los haplotipos HLA extendidos varían más rápido que los alelos en las poblaciones. Se concluye que este modelo único de estudio de familias aisladas amerindias sugiere que la variación rápida de haplotipos HLA puede ser más importante que la variación de alelos para la supervivencia (respuestas inmunitarias iniciales). Este trabajo también puede ser útil para futuros programas de trasplantes en el área. Se concluye que este modelo único de estudio de familias aisladas amerindias sugiere que la variación rápida de haplotipos HLA puede ser más importante que la variación de alelos para la supervivencia (respuestas inmunitarias iniciales). Este trabajo también puede ser útil para futuros programas de trasplantes en el área. Se concluye que este modelo único de estudio de familias aisladas amerindias sugiere que la variación rápida de haplotipos HLA puede ser más importante que la variación de alelos para la supervivencia (respuestas inmunitarias iniciales). Este trabajo también puede ser útil para futuros programas de trasplantes en el área. eng: America first inhabitants and peopling are still debated. In order to increase knowledge about these questions, we have aimed to detect HLA genes of an Amerindian secluded community: Jaidukama, who lives in North Colombia Equatorial forest. HLA genotyping and extended haplotype calculations were carried out in 39 healthy individuals belonging to 13 families. HLA frequencies were compared to other Amerindians and worldwide populations by calculating genetic distances, relatedness dendrograms and correspondence analyses. Only four DRB1 alleles were found (*0404, *0407, *1402 and *1602); however a total of 17 Amerindian different extended class I–class II HLA haplotypes were directly counted from the family studies, nine of them were specific of Jaidukamas. Some of the alleles or group of alleles within an extended haplotype (i.e. DQB1–DRB1) were also found in Asians and Pacific Islanders, further supporting existence of Asian and Pacific gene flow with Amerindians or a common founder effect. It is further supported that HLA extended haplotypes vary faster than alleles in populations. It is concluded that this unique model of Amerindian secluded families study suggests that rapid HLA haplotype variation may be more important than allele variation for survival (starting immune responses). This work may also be useful for future transplant programs in the area.
Databáze: OpenAIRE
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