Epidemiology and performance of molecular assays from zika, dengue and chikungunya fever suspected cases in the southeastern region of Mato Grosso

Autor: Roma, José Henrique Francisco, 1981
Přispěvatelé: Resende, Mariângela Ribeiro, 1966, Pavoni, Juliana Helena Chavez, Arns, Clarice Weis, Castro, Ludiele Souza, Universidade Estadual de Campinas. Faculdade de Ciências Médicas, Programa de Pós-Graduação em Clínica Médica, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINAS
Jazyk: portugalština
Rok vydání: 2022
Předmět:
Zdroj: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)
Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)
instacron:UNICAMP
Popis: Orientadores: Mariângela Ribeiro Resende, Juliana Helena Chavez Pavoni Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciências Médicas e Universidade Federal de Rondonópolis Resumo: Introdução: As arboviroses representam um problema de saúde pública em todo o mundo, especialmente em países em desenvolvimento, causando síndromes febris agudas semelhantes com graves prejuízos à saúde humana e mortalidade. Neste sentido, a notificação adequada e o diagnóstico preciso tem sido um desafio em países endêmicos para o vírus Dengue (DENV), especialmente após a introdução dos vírus Zika (ZIKV) e Chikungunya (CHIKV). Objetivos: Este estudo teve como objetivo analisar as características clínicas, epidemiológicas e sorológicas de pacientes com síndrome febril aguda e suspeita das arboviroses dengue, zika e chikungunya, notificados durante a primeira epidemia de ZIKV no Brasil, ocorrida nos anos de 2015 e 2016, na região Sudeste de MT. Além disso, avaliou-se a performance de protocolos de Reação em Cadeia da Polimerase precedida de Transcrição Reversa (nested-RT-PCR) em um cenário de epidemia de ZIKV considerando a RT-qPCR como teste de referência. Metodologia: As características epidemiológicas e clínicas dos arboviroses foram analisadas em uma coorte retrospectiva descritiva com 197 participantes. A determinação da sensibilidade e especificidade dos ensaios moleculares nested-RT-PCR e RT-qPCR para ZIKV, DENV e CHKV e a avaliação sorológica por detecção de anticorpos IgM e IgG anti-ZIKV foram realizadas em 179 amostras de soro. Resultados: Dos 197 pacientes participantes do estudo, 63% eram do sexo feminino, oito estavam grávidas. A média de idade foi de 32 anos, com 44% entre 19-59 anos; 28% eram brancos, 34% tinham instrução educacional e 58,9% eram residentes urbanos. Cerca de 61% dos casos ocorreram durante as estações chuvosas, sendo 12,1% em três regiões da área de estudo. Distúrbios musculoesqueléticos foram as principais queixas (22,8%), seguidas de exantema e petéquias (12,6%), febre (13,7%), cefaleia (11,7%), prurido (10%), manifestações oftalmológicas (6,1%) e gastrintestinais (5,6%). Ensaios moleculares detectaram 8,9% e 3,3% das amostras positivas para os vírus zika e dengue, respectivamente. Os ensaios sorológicos para Zika mostraram 10,6% de amostras positivas para IgM e 55,8% para IgG. Pelos protocolos moleculares, na RT-qPCR, 3 (1,67%) amostras foram positivas para DENV e 16 (8,94%) foram positivas para ZIKV, enquanto no RT-PCR 5 (2,79%) amostras foram determinadas como positivas para DENV e 3 (1,67%) para ZIKV. O RNA de CHIKV não foi detectado nas amostras testadas. A sensibilidade e especificidade da nested- RT-PCR para DENV foram 66,66% e 98,29%, respectivamente; A detecção de RNA do ZIKV teve 18,75% de sensibilidade e 100% de especificidade com o protocolo nested-RT-PCR, com acurácia de 97,76% e 92,74% para DENV e ZIKV, respectivamente. Conclusão: Este estudo fornece perfil clínico, epidemiológico e de performance laboratorial de relevância singular para a compreensão da circulação desses arbovírus na região estudada por seu caráter inédito para o local, em uma emergência do ZIKV e cenário de alta endemicidade do DENV. O estudo nos permite compreender a introdução e ocorrência concomitante de uma arbovirose emergente, além de estabelecer o ensaio de RT-qPCR como o método mais confiável para diagnosticar casos suspeitos de dengue e febre zika, fornecendo resposta laboratorial precisa e oportuna para o manejo adequado dos pacientes Abstract: Introduction: Arboviruses represent a public health problem worldwide, especially in developing countries, causing similar acute febrile syndromes with serious harm to human health and mortality. These viruses cause similar acute febrile syndromes. In this sense, adequate reporting and accurate diagnosis have been a challenge in endemic countries for Dengue virus (DENV), especially after the introduction of Zika (ZIKV) and Chikungunya (CHIKV) viruses. Objective: This study aimed to analyze the clinical, epidemiological, and serological characteristics of patients with acute febrile syndrome and suspected of dengue, zika and chikungunya arboviruses, reported during the first ZIKV outbreak in Brazil, which occurred from 2015 to 2016 in the Southern region of MT State. In addition, the evaluation of Reverse Transcription Polimerase Chain Reaction (nested-RT-PCR) protocols considering RT-qPCR as a reference test was performed in a ZIKV epidemic scenario. Methods: The epidemiological and clinical characteristics of arboviruses were analyzed in a descriptive retrospective cohort with 197 participants. Determination of sensitivity and specificity of nested-RT-PCR and RT- qPCR molecular assays for ZIKV, DENV and CHKV and serological evaluation by detection of anti-ZIKV IgM and IgG antibodies were performed in 179 serum samples. Results: Of the 197 patients participating in the study, 63% were female, eight were pregnant. The mean age was 32 years, with 44% between 19-59 years; 28% were white, 34% were scholarity and 58.9% were urban residents. About 61% of the cases occurred during the rainy seasons, with 12.1% in three regions of the study area. Musculoskeletal disorders were the main complaints (22.8%), followed by rash and petechiae (12.6%), fever (13.7%), headache (11.7%), pruritus (10%), ophthalmologic (6.1%) and gastrointestinal (5.6%) manifestations. Molecular assays detected 8.9% and 3.3% of Zika and Dengue viruses, respectively. Serological assays for ZIKV showed 10.6% of samples positive for IgM and 55.8% for IgG. By molecular protocols, in RT-qPCR, 3 (1.67%) samples were positive for DENV and 16 (8.94%) were positive for ZIKV, while in RT-PCR 5 (2.79%) samples were determined as positive for DENV and 3 (1.67%) for ZIKV. CHIKV RNA was not detected. The sensitivity and specificity of nested-RT-PCR for DENV were 66.66% and 98.29%, respectively; The detection of ZIKV RNA had 18.75% sensitivity and 100% specificity with the nested-RT-PCR protocol, with an accuracy of 97.76% and 92.74% for DENV and ZIKV, respectively. Conclusion: This study provides clinical, epidemiological profile and laboratory performance of singular relevance to the understanding of the circulation of these arboviruses in the region studied due to their unprecedented data for the place, in a ZIKV emergency and a scenario of high DENV endemicity. The study allows us to understand the introduction and concomitant occurrence of an emerging arbovirus, in addition to establishing the RT-qPCR assay as the most reliable method for diagnosing suspected cases of dengue and zika fever, providing an accurate and timely laboratory response for the proper management of the patients Mestrado Clínica Médica Mestre em Ciências CNPQ 432056/2016-5 FAPEMAT 0226317/2017
Databáze: OpenAIRE
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