CARACTERIZACIÓN DE LA ADN POLIMERASA DEL VIRUS DE LA MANCHA BLANCA (WSSV) Y LA PROTEÍNA ACCESORIA PCNA (Proliferating Cell Nuclear Antigen) DEL CAMARÓN BLANCO Litopenaeus vannamei
Autor: | ENRIQUE DE LA RE VEGA |
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Přispěvatelé: | Rogerio Sotelo_Mundo, LUIS GABRIEL BRIEBA DE CASTRO |
Jazyk: | Spanish; Castilian |
Rok vydání: | 2011 |
Předmět: | |
Zdroj: | Centro de Investigación en Alimentación y Desarrollo CIAD Repositorio Institucional del CIAD |
Popis: | "El virus de la mancha blanca (WSSV) es uno de los virus más letales que afectan la camaronicultura, ya que puede causar el 100% de mortalidad en solo unas horas en un estanque. Este virus no solo infecta al camarón sino a un gran número de especies de crustáceos, por eso de la importancia del estudio de su genoma. El marco de lectura (ORF) 514 se había reportado, hasta la realización de este trabajo, como un ORF “putativo” codificante de una ADN polimerasa viral. Este tipo de proteínas involucradas en la replicación del ADN se han vuelto blanco de fármacos antivirales, por lo que es de gran importancia su caracterización, ya que conociendo su función se pudieran realizar trabajos con el objetivo de inhibir la replicación viral. En este trabajo se realizó la caracterización del ORF514, así como el estudio de una proteína accesoria en la replicación, el PCNA (Proliferating cell nuclear antigen) de Litopenaeus vannamei. El PCNA esta reportado que confiere una mayor procesividad a las polimerasas durante la replicación del ADN. En este trabajo de tesis se encontró que el marco de lectura 514 tiene actividad de polimerasa ya que incorporo nucleótidos a una cadena molde de ADN. Así mismo, se identificaron los dominios polimerasa y exonucleasa, así como los sub dominios de los dedos, pulgar y palma de acuerdo a una modelación molecular predictivo. Este trabajo incluye la caracterización del ADNc de PCNA de camarón y su expresión génica durante una infección del camarón con el WSSV. Se caracterizó la secuencia completa codificante del PCNA y se identificaron los dominios involucrados en la interacción PCNA/ADN/ADN polimerasa en el modelo molecular teórico. Adicionalmente, se cuantificaron los niveles de ARNm de los genes de PCNA y de la WSSV ADN polimerasa, mediante la transcripción reversa y PCR cuantitativo (qRT-PCR), se pudo observar que el gen de la WSSV ADN polimerasa aumenta su expresión conforme aumenta la infección, mientras que el PCNA mantiene su expresión a lo largo de la infección viral. Con base en los resultados obtenidos en este trabajo en donde se identificó la actividad de polimerasa del ORF514, se pudiera dirigir algún tipo de inhibición hacia esta enzima, dado que se pudo identificar su actividad y su expresión a lo largo de una infección con el WSSV." |
Databáze: | OpenAIRE |
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