Genetic architecture of residual feed intake in Nelore cattle

Autor: Silva, Beatriz Pressi Molina da
Přispěvatelé: Universidade Estadual Paulista (Unesp), Silva, Josineudson Augusto II Vasconcelos [UNESP]
Jazyk: portugalština
Rok vydání: 2018
Předmět:
Zdroj: Repositório Institucional da UNESP
Universidade Estadual Paulista (UNESP)
instacron:UNESP
Popis: Submitted by Beatriz Pressi Molina da Silva (beatrizpressi@gmail.com) on 2018-09-05T20:13:24Z No. of bitstreams: 1 Beatriz_Versao_Final.pdf: 1270071 bytes, checksum: aaa6d756e5f3c9b32a9a0c8de52f2132 (MD5) Approved for entry into archive by Alexandra Maria Donadon Lusser Segali null (alexmar@fcav.unesp.br) on 2018-09-06T17:37:57Z (GMT) No. of bitstreams: 1 silva_bpm_me_jabo_par.pdf: 575240 bytes, checksum: 066c0b3c66a89f2e56f647705f916b1e (MD5) Made available in DSpace on 2018-09-06T17:37:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 silva_bpm_me_jabo_par.pdf: 575240 bytes, checksum: 066c0b3c66a89f2e56f647705f916b1e (MD5) Previous issue date: 2018-08-16 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) A alimentação é o componente mais dispendioso e relevante na produção de bovinos de corte. Com a necessidade de tornar a bovinocultura de corte mais rentável e sustentável, características de eficiência alimentar ganharam importância, entretanto, apresentam dificuldades pela onerosa obtenção da informação. A característica relacionada a eficiência alimentar e com mais estudos na última década, consumo alimentar residual (CAR), possui independência fenotípica de características de crescimento e de produção. O avanço na utilização da tecnologia de marcadores moleculares, como os SNPs, possibilitou o uso de novas ferramentas genômicas. Neste sentindo, é de interesse econômico e científico investigar mecanismos genéticos e biológicos que influenciam o CAR. O objetivo do estudo foi identificar regiões genômicas associadas ao CAR, avaliar diferenças genômicas em grupos contrastantes de animais, além de estimar os efeitos da substituição alélica de SNP que apresentem diferentes frequências alélicas em bovinos Nelore (Bos indicus). Foram utilizadas informações fenotípicas de 946 animais participantes do teste de eficiência alimentar nos anos de 2010 a 2017, com informação de genótipos de 956 animais. O modelo abordado para predição dos valores genéticos foi o WssGBLUP/S2, e a cada iteração foram reestimados efeitos de SNPs a partir de valores genético genômico (GEBVs). Foram encontradas oito regiões explicando variância genética total acima de 1%, totalizando 12,25% da variância genética total do CAR, localizadas nos cromossomos 5, 6, 9, 11, 14, 17 e 27, com 71 genes identificados, indicando existência de QTL associados ao CAR nestas regiões do genoma. A classificação de genes quanto a função biológica foi realizada pelo pacote topGO e as principais vias metabólicas associadas ao CAR foram relacionadas com função mitocondrial e metabolismo energético. O CAR apresentou estimativa de herdabilidade moderada (0,24) utilizando matriz genômica associada à matriz de parentesco (H). A partir do fenótipo ajustado, 20% dos animais presentes nos extremos da característica foram divididos em eficientes e não eficientes. Foi realizado teste exato de Fisher (p
Databáze: OpenAIRE
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