Studies of the interaction of Rose Bengal with the Human Serum Albumin (HSA) protein under experimental and theoretical aspects in the characterization of binding sites

Autor: Yoguim, Maurício Ikeda
Přispěvatelé: Universidade Estadual Paulista (Unesp), Souza, Aguinaldo Robinson de [UNESP], Ximenes, Valdecir Farias [UNESP], Caracelli, Ignez [UNESP]
Jazyk: portugalština
Rok vydání: 2021
Předmět:
Zdroj: Repositório Institucional da UNESP
Universidade Estadual Paulista (UNESP)
instacron:UNESP
Popis: Submitted by Mauricio Ikeda Yoguim (mauricio.yoguim@unesp.br) on 2022-01-03T13:06:07Z No. of bitstreams: 1 Tese_MauricioYoguim.pdf: 6816503 bytes, checksum: 565b3d65946201ab716de3e71d1202da (MD5) Approved for entry into archive by Lucilene Cordeiro da Silva Messias null (lubiblio@bauru.unesp.br) on 2022-01-03T18:43:57Z (GMT) No. of bitstreams: 1 yoguim_mi_dr_bauru.pdf: 6455993 bytes, checksum: d5c8fd7e76cfc51ef48310f3ee4a0666 (MD5) Made available in DSpace on 2022-01-03T18:43:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 yoguim_mi_dr_bauru.pdf: 6455993 bytes, checksum: d5c8fd7e76cfc51ef48310f3ee4a0666 (MD5) Previous issue date: 2021-11-19 O corante Rosa de Bengala (RB) é um xanteno que possui algumas propriedades interessantes, como converter fotocatalíticamente moléculas de oxigênio para o estado singlete (1O2), e alterar a sua coloração de acordo com o valor de pH do meio. A compreensão da interação entre esse corante à macromoléculas biológicas é muito importante, porque estes estudos permitem compreender a formação de complexos como a proposição de mecanismos de interação e reação, estudos de reconhecimento à nível atômico e molecular dos sítios de ligação e a identificação das interações determinantes no processo de sua formação. A proteína escolhida para esse estudo foi a albumina do soro humano (HSA), que possui 9 sítios ativos para ácidos graxos (FA), ou 3 sítios de Sudlow, na qual é responsável por carrear compostos endógenos e exógenos para todo o organismo humano. Com os experimentos de Job´s Plot foi possível determinar que 6 estruturas do corante estão interagindo à estrutura da proteína, e estes possuem um valor médio de 3,90 ± 0,08 x 105 M-1 (constante de associação). Como o corante se interage à estrutura da proteína, averigou quais são os sítios ativos que o corante teve maior afinidade, desse modo, realizou tanto os experimentos laboratoriais (competição de sítios), como teóricos (docking molecular). Para os resultados experimentais foram observados que o RB possui afinidades aos sítios Sudlow I (IIA), FA1 (IB) e FA6 (IIB), e não ao sítio Sudlow II (IIIA). Com os estudos de docking molecular foram comprovados os mesmos resultados obtidos experimentalmente, e ainda foi possível identificar uma possível região preferencial ao sítio FA6. Os estudos termodinâmicos auxiliaram a compreender melhor a formação desse complexo, desse modo tem-se um ∆H>0 (endotérmico), ∆S>0 (grau de desordem mínimo) e ∆G0 (endothermic), ∆S>0 (minimum degree of disorder) and ∆G
Databáze: OpenAIRE
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