ANÁLISIS BIOINFORMATICO DE LAS SECUENCIAS DE AMINOÁCIDOS DE DIVERSAS FOSFOLIPASAS D

Autor: Solis Calero, Christian
Jazyk: Spanish; Castilian
Rok vydání: 2019
Předmět:
Zdroj: Revista ECIPerú; Vol. 1 Núm. 1 (2004); 3
ECIPERÚ
Centro Nacional de Planeamiento Estratégico
instacron:CEPRECYT
ISSN: 1813-0194
Popis: Phospholipases D are enzymes present in all eucariotic organisms, it was first discovered in plants and in recent years, increasing attention has been paid to its roles in signal transduction in mammals. Human isoforms of this enzyme D1 and D2 were analyzed using bioinformatic tools, predicting their chemical properties responsible of their different levels of action. Besides, using local multiply alignment programs like MACAW with amino acid sequences from different organisms, three conserved blocks of sequences in all organisms were detected. Between Plant sequences and not with bacterial, high similarity was detected. When these conserved blocks of sequence was visualized in determined experimentally 3D structure of Phospolipase D from Streptomyces Sp , an structural zone having near these blocks of sequence, was observed. This zone is postulated like an important structural feature of these enzymes that possibly contain essential amino acid residues for their biological activity. La Fosfolipasa D es una enzima presente en todos los organismos eucariotas, su papel en los mecanismos de señalización intracelular ha sido bastante estudiado en plantas, no obstante el rol que cumplen en mamíferos todavía no ha sido destacado respecto a otros moduladores de la señalización intracelular. Por ello se analizo insilico las secuencias de aminoácidos de las isoformas humanas D1 y D2 de la Fosfolipasa D, obteniendo la predicción de sus propiedades químicas responsables de sus diferentes niveles de acción. Usando el programa MACAW realizamos alineamientos múltiples locales de secuencias obtenidas de la base de datos NR del NCBI correspondientes a la “Fosfolipasa D” de varias especies encontrando sólo un segmento conservado entre las secuencias de origen bacteriano, y ocho entre las secuencias de origen vegetal. Se detecto además tres segmentos de secuencia de aminoácidos comunes en secuencias de especies de distante origen filogenético, la visualización de estos segmentos en la estructura 3D de la fosfolipasa D de la Bacteria Streptomyces Sp nos revelo que los residuos de aminoácidos altamente conservados de estos segmentos se localizan cercanamente formando una zona en la proteína que probablemente contiene los residuos esenciales para su actividad.
Databáze: OpenAIRE
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