Uso otimizado de marcadores SSR para identificação varietal de algodoeiro herbáceo

Autor: PEREIRA, G. DA S., CAZÉ, A. L. R., SILVA, M. G. DA, ALMEIDA, V. C., MAGALHAES, F. O. da C., SILVA FILHO, J. L. da, BARROSO, P. A. V., HOFFMANN, L. V.
Přispěvatelé: GUILHERME DA SILVA PEREIRA, UEPB, ANA LUIZA RAMOS CAZÉ, UEPB, MICHELLE GARCIA DA SILVA, UEPB, VANESSA CAVALCANTE ALMEIDA, UEPB, FERNANDA OLIVEIRA DA C MAGALHAES, CNPA, JOAO LUIS DA SILVA FILHO, CNPA, PAULO AUGUSTO VIANNA BARROSO, EMBRAPA AGROENERGIA, LUCIA VIEIRA HOFFMANN, CNPA.
Jazyk: portugalština
Rok vydání: 2015
Předmět:
Zdroj: Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA-Alice)
Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)
instacron:EMBRAPA
Popis: O objetivo deste trabalho foi identificar marcadores polimórficos de sequências simples repetidas (SSR) para identificação varietal de algodão e avaliação da distância genética entre as variedades. Inicialmente, 92 marcadores SSR foram genotipados em 20 cultivares de algodão do Brasil. Desse total, 38 locos foram polimórficos, dos quais dois deles foram amplificados por um único par de iniciadores; o número médio de alelos por loco foi 2,2. Os conteúdos de informação polimórfica (PIC) e de poder de discriminação (DP) foram, em média, 0,374 e 0,433, respectivamente. A distância genética média foi de 0,397 (mínima de 0,092 e máxima de 0,641). Um painel de 96 variedades originárias de diversas regiões do mundo foi avaliado por 21 locos polimórficos derivados a partir de 17 pares de iniciadores selecionados. Entre essas variedades, a distância genética média foi de 0,387 (mínima de 0 e máxima de 0,786). Os dendrogramas elaborados a partir de média aritmética não ponderada (UPGMA) não refletiram as regiões do Brasil (20 genótipos) ou do mundo (96 genótipos), onde as variedades ou linhagens foram selecionadas. O procedimento de reamostragem bootstrap mostra que a identificação dos genótipos é viável com 19 locos. Os marcadores polimórficos avaliados são úteis na identificação varietal de um painel amplo de variedades de algodão e podem ser aplicados em estudos de diversidade da espécie.
Databáze: OpenAIRE
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