Evaluation of antimicrobial susceptibility and macrorestriction DNA of human isolates of Salmonella serovar Typhimurium phage type 193 in the period 1970 to 2008

Autor: Reis, Eliane Moura Falavina dos
Přispěvatelé: Hofer, Ernesto, Freitas-almeida, Angela Corrêa de, Marques, Elizabeth de Andrade, Ignacio, Ana Claudia de Paula Rosa, Rodrigues, Dália dos Prazeres, Silva, Deyse Christina Vallim da
Jazyk: portugalština
Rok vydání: 2011
Předmět:
Zdroj: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UERJ
Universidade do Estado do Rio de Janeiro (UERJ)
instacron:UERJ
Popis: Submitted by Boris Flegr (boris@uerj.br) on 2021-01-07T15:13:39Z No. of bitstreams: 1 TESE ELIANE FINAL 07072011[1].pdf: 1053689 bytes, checksum: db7f3b43e7478027a2ee58c5ddf1022f (MD5) Made available in DSpace on 2021-01-07T15:13:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TESE ELIANE FINAL 07072011[1].pdf: 1053689 bytes, checksum: db7f3b43e7478027a2ee58c5ddf1022f (MD5) Previous issue date: 2011-06-09 To analyze strains of Salmonella ser. Typhimurium isolated from human cases of enteric and extraintestinal occurred during the period 1970 to 2008 of different regions of Brazil were selected, based on records in the database from Enterobacteria Laboratory of IOC / FIOCRUZ, RJ, samples prevalent phage type 193 in order to recognition of epidemic clones. We selected 553 strains of Salmonella ser. Typhimurium phage type 193 represented by 91, 65, 70 and 327 samples concerning the 1970s, 1980s, 1990s and the period from 2000 to 2008, respectively. In a global analysis of the sensitivity of these strains, 52% had one or more antibiotic resistance markers included in the profile ACSSuT. This resistance profile was found complete in 20.9% of isolates and the remaining 21.9%, sensitive to all drugs tested, especially in the period 2000 to 2008, represented by 121 samples (37.0%) compared the 327 cultures of that time. The highest percentage of resistance was observed in the samples of the 70 (99%) being the profile ACSSuT detected in 35.2% of isolates, emphasizing that all strains were isolated from gastrointestinal processes occurring in São Paulo city. Over the four decades of study, we describe a breaking point between the prevalence of resistance and susceptibility in the transition between the 1980s and 1990s. Although the number of isolates of Salmonella ser. Typhimurium phage type 193 has increased in the last period, the percentage of mono-and multidrug resistance to antimicrobial agents stood at high level (63.0%). The analysis of polymorphism obtained after macrorestriction with the enzyme XbaI showed that isolates in the 1990s showed a high percentage of similarity (≥ 85%) with strains isolated recently (2000-2008) and are grouped in the same subclusters. Moreover, the strains of the 1970s fall into subclusters independent, although the percentage of similarity between such subclusters and the other is ≥ 70%, the same was observed for the strains isolated during the 1980s. In conclusion, this study showed that the prevalence of human isolates of Salmonella ser. Typhimurium phage type 193 in Brazil has been progressing since the 1990s, while the detection of R model (ACSSuT) is decreasing and evaluation by PFGE indicated the presence of multiple profiles macrorestriction in phage type 193, however with high percentages of similarity, suggesting some clonality in view the period between isolation and analysis Para analisar cepas de Salmonella ser. Typhimurium isoladas de processos entéricos e extraintestinais humanos ocorridos no período de 1970 a 2008 de diferentes regiões do país foram selecionadas, com base nos registros contidos no banco de dados do Laboratório de Enterobactérias do IOC/FIOCRUZ, RJ, amostras do fagotipo prevalente 193, visando precipuamente o reconhecimento de clones epidêmicos. Foram selecionadas 553 cepas de Salmonella ser. Typhimurium fagotipo 193 representadas por 91, 65, 70 e 327 amostras referentes as décadas de 70, 80, 90 e ao período de 2000 a 2008, respectivamente. Na análise global da sensibilidade destas cepas, 52% apresentaram um ou mais marcadores de resistência a antibióticos incluídos no perfil ACSSuT. Este perfil de resistência completo foi verificado em 20,9% dos isolados, sendo os 21,9% restantes, sensíveis a todas as drogas testadas, especialmente no período de 2000 a 2008, representadas por 121 amostras (37,0%) em relação as 327 culturas dessa época. O maior percentual de resistência foi observado nas amostras da década de 70 (99%) sendo o perfil ACSSuT detectado em 35,2% dos isolados, ressaltando-se que todas as amostras foram isoladas de processos gastroentéricos ocorridos na cidade de São Paulo. Ao longo das quatro décadas de estudo, descreve-se um ponto de ruptura entre a prevalência de resistência e a suscetibilidade na transição entre as décadas de 80 e 90. Embora o número de isolados de Salmonella ser. Typhimurium fagotipo 193 tenha aumentado no último período considerado, o percentual de mono e multirresistência aos antimicrobianos se situou em nível elevado (63,0%). A análise do polimorfismo obtido após macrorrestrição com a enzima XbaI revelou que cepas isoladas na década de 90 apresentaram elevado percentual de similaridade (≥85%) com cepas isoladas recentemente (período de 2000-2008), sendo agrupadas nos mesmos subclusters . Por outro lado, as cepas da década de 70 inserem-se em subclusters independentes, embora o percentual de similaridade entre tais subclusters e os demais seja ≥70%; o mesmo sendo observado para as cepas isoladas durante a década de 80. Em conclusão, este estudo mostrou que a prevalência de isolados humanos de Salmonella ser. Typhimurium fagotipo 193 no Brasil vem progredindo desde a década de 1990, enquanto a detecção do modelo R (ACSSuT) está diminuindo e a avaliação através da PFGE indicou a presença de multiplicidade de perfis de macrorrestrição no fagotipo 193, entretanto com elevados percentuais de similaridade entre si, sugerindo alguma clonalidade, tendo em vista o período entre o isolamento e a análise
Databáze: OpenAIRE
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