РНК СЕКВЕНИРОВАНИЕ ПРИ ПЛОСКОКЛЕТОЧНОМ РАКЕ ПИЩЕВОДА: ОТ ЗАБОРА БИОМАТЕРИАЛА ДО СЕКВЕНИРОВАНИЯ НА HISEQ2000
| Jazyk: | ruština |
|---|---|
| Rok vydání: | 2016 |
| Předmět: | |
| Zdroj: | Наука и здравоохранение. |
| ISSN: | 2410-4280 |
| Popis: | В Казахстане отмечается высокая заболеваемость плоскоклеточным раком пищевода, частота заболеваемости составляет 10,1:100 000. В структуре смертности рак пищевода среди мужчин занимает 5-ое, среди женщин 9-ое место в республике Казахстан. Молекулярные механизмы, способствующие инициации и прогрессированию онкопатологии еще недостаточно изучены. Тем не менее, отсутствие чувствительных и специфичных биомаркеров для диагностики онкозаболеваний подчеркивает необходимость дополнительных исследований по изучению развития канцерогенеза. В этом аспекте перспективным является исследование транскриптомного профиля опухолевых клеток. В работе представлено описание этапов пробоподготовки и РНК секвенирования на основе технологии секвенирования нового поколения. Каждый этап от момента забора биоматериала, выделения тотальной РНК, подготовка библиотеки оказывают влияние на получение качественных данных при последующем секвенировании. The squamous esophageal cancer is a disease which is highly frequent in Kazakhstan, the frequency of the disease is 10,1:100 000. In the mortality structure esophageal cancer takes place among men the 5th place, among women the 9th place in the Republic of Kazakhstan. The molecular mechanisms which contribute to the initiation and progression of the cancer pathology are not investigated enough. Nevertheless, the lack of the sensitive and specific biomarkers for the diagnosis of the cancer diseases, underlines about the necessity of the additional research works to study about the development of carcinogenesis. Investigation of the transcriptome profile of tumor cells is perspective in this aspect of the study. The paper describes the stages of the sample preparation and sequencing of RNA, based on a new generation sequencing technology. Each step from the moment of the sampling of biological material, isolation of total RNA, preparation of libraries have an impact on obtaining of the high-quality data in subsequent sequencing. |
| Databáze: | OpenAIRE |
| Externí odkaz: |
|