Popis: |
Решена с разрешением 1.1 A кристаллическая структура тройного комплекса НАД+-зависимой формиатдегидрогеназы из метилотрофной бактерии Moraxella sp. С-1 с кофактором (НАД+) и ингибитором (ионом азида), имитирующая структуру переходного состояния ферментативной реакции. Структура уточнена с учетом анизотропии тепловых колебаний неводородных атомов до R -фактора 13.4 %. На основании анализа значений температурных факторов и пиков электронной плотности удалось различить большинство атомов азота, кислорода и углерода, что дало возможность однозначно установить поворотные изомеры боковых цепей остатков гистидина и большинства остатков аспарагина и глютамина. Проведен сравнительный анализ структур тройного комплекса с атомным разрешением и с разрешением 1.95 A. В структуре атомного разрешения обнаружена тенденция к изменению длин ковалентных связей никотинамидной группы кофактора, согласующаяся с данными квантовомеханических расчетов, указывающими на приобретение кофактором характера биполярной формы в переходном состоянии ферментативной реакции. |