Филогенетическая структура и характеристики эволюционных возрастов штаммов сибирского и дальневосточного генотипов вируса клещевого энцефалитав природных экосистемах Евразии

Jazyk: ruština
Rok vydání: 2015
Předmět:
Zdroj: Сибирский медицинский журнал (Иркутск).
ISSN: 1815-7572
Popis: В работе демонстрируются возможности современных биоинформационных подходов в исследовании молекулярной эпидемиологии и эволюции вируса клещевого энцефалита (ВКЭ). С помощью программ MEGA, GenGIS и BEAST получена новая информация относительно филогении и филогеографии возбудителя. Результаты исследования свидетельствуют, что ареал сибирского генотипа ВКЭ охватывает регионы Сибири и Восточной Европы. Внутри сибирского и дальневосточного генотипов штаммы подразделились на три стации - восточно-сибирский, западно-сибирский, восточноевропейский, а также дальневосточный (Дальний Восток России), китайский и японский, соответственно. По эволюционному возрасту наиболее древними являются штаммы сибирского генотипа, приблизительно 1324 лет назад они сформировали отдельную эволюционную ветвь, а современные штаммы дальневосточного генотипа - около 1136 лет назад
The work demonstrates the possibilities of modern bioinformatics approaches in the study of molecular epidemiology and evolution of the virus of tick-borne encephalitis (TBE). With the program MEGA, GenGIS and BEAST there has been received a new information concerning the phylogeny and phylogeography of the causative agent. The findings suggest that the area of the Siberian genotype TBE covers the regions of Siberia and Eastern Europe. Inside the Siberian and Far Eastern strains genotypes are divided into three habitats East Siberian, West Siberian, East European and Far East (Russian Far East), Chinese and Japanese, respectively. According to the evolutionary age of the ancient Siberian genotype strains are approximately 1324 years old, they formed a separate evolutionary branch and strains of modern Far East genotype are about 1136 years old
Databáze: OpenAIRE
Externí odkaz: