Генетическая характеристика вируса Баткен (bknv-batken virus) (Orthomyxoviridae, Thogotovirus), изолированного из иксодовых клещей Hyalomma marginatum Koch, 1844 и комаров Aedes caspius Pallas, 1771 и Culex hortensis Ficalbi, 1889 в Средней Азии
| Jazyk: | ruština |
|---|---|
| Rok vydání: | 2014 |
| Předmět: | |
| Zdroj: | Вопросы вирусологии. |
| ISSN: | 2411-2097 0507-4088 |
| Popis: | Методом полногеномного секвенирования (MiSeq, illumina) определена практически полная нуклеотидная последовательность генома вируса Баткен (BKNV Batken virus) (iD GenBank KJ396672-4). Прототипный штамм LEiV-K306 BKNV изолирован от иксодовых клещей Hyalomma marginatum Koch, 1844, собранных с овец в окрестностях районного центра Баткен в Киргизии в апреле 1970 г. Впоследствии на территории Киргизии BKNV был изолирован из смешанного пула комаров Aedes caspius Pallas, 1771 и Culex hortensis Ficalbi, 1889. Ранее было установлено, что BKNV чрезвычайно близок к вирусу Дхори (DHOV Dhori virus) (Orthomyxoviridae, Thogotovirus), впервые изолированному от иксодовых клещей Hyalomma dromedarii Koch, 1844 в Индии. В настоящей работе показано, что структурные и неструктурные белки BKNV обладают высоким уровнем гомологии с DHOV 98% (PB1) и 96% (PB2, PA, NP, M). Уровень гомологии поверхностного гликопротеина HA у BKNV и DHOV составляет 90%, что объясняет антигенные различия между этими близкородственными вирусами. Поскольку гомология остальных структурных и неструктурных белков BKNV и DHOV составляет 96-98%, можно заключить, что BKNV является топотипным вариантом DHOV, характерным для Средней Азии, Закавказья и Северного Прикаспия. Эволюционное расхождение BKNV и DHOV по поверхностному гликопротеину, вероятно, связано с локальными экологическими особенностями ареала BkNv. The prototype strain LEiV-K306 of the Batken virus (BKNV) was isolated from the ixodidae ticks Hyalomma marginatum Koch, 1844 collected from sheep near town Batken (Kirgizstan) in the April 1970. Later, the BKNV was isolated in Kirgizstan from the mixed pool of the Aedes caspius Pallas, 1771 and Culex hortensis Ficalbi, 1889 mosquitoes. From the very beginning, the BKNV was discussed to be very close to the Dhori virus (DHOV) (Orthomyxoviridae, Thogotovirus) isolated from the ixodidae ticks Hyalomma dromedarii Koch, 1844 in india. in this work, virtually complete genome sequence (Miseq, illumina) of the BKNV was determined (iD GenBank KJ396672-4). Structural and non-structural proteins of the BKNV have a high level of homology with DHOV 98% (PB1) and 96% (PB2, PA, NP, M). Homology of HA protein between the BKNV and DHOV is 90%, which accounts for antigenic difference between these close relative viruses. Since the differences in the other structural and non-structural proteins are about 96-98%, the BKNV could be suggested as the topotypic DHOV strain for Central Asia, Transcaucasia, and Northern Caspian region. The evolution divergence of the BKNV and DHOV for HA could be explained by local ecologic peculiarities of the BKNV areal. |
| Databáze: | OpenAIRE |
| Externí odkaz: |
|
