| Autor: |
Deschamps, Estelle |
| Přispěvatelé: |
Chimie Organique et Bioorganique : Réactivité et Analyse (COBRA), Institut Normand de Chimie Moléculaire Médicinale et Macromoléculaire (INC3M), Institut de Chimie du CNRS (INC)-École Nationale Supérieure d'Ingénieurs de Caen (ENSICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut national des sciences appliquées Rouen Normandie (INSA Rouen Normandie), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Normandie Université (NU)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Le Havre Normandie (ULH), Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-École Nationale Supérieure d'Ingénieurs de Caen (ENSICAEN), Normandie Université (NU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie Organique Fine (IRCOF), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Normandie Université (NU)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Polymères Biopolymères Surfaces (PBS), Institut national des sciences appliquées Rouen Normandie (INSA Rouen Normandie), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Normandie Université (NU)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Normandie Université (NU)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut Normand de Chimie Moléculaire Médicinale et Macromoléculaire (INC3M), Normandie Université (NU)-École Nationale Supérieure d'Ingénieurs de Caen (ENSICAEN), Normandie Université (NU)-Université Le Havre Normandie (ULH), Normandie Université (NU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Normandie Université, Stéphane Alexandre, Corinne Loutelier-Bourhis |
| Jazyk: |
francouzština |
| Rok vydání: |
2020 |
| Předmět: |
|
| Zdroj: |
Chimie thérapeutique. Normandie Université, 2020. Français. ⟨NNT : 2020NORMR054⟩ |
| Popis: |
Pseudomonas aeruginosa is a highly pathogenic bacterium for cystic fibrosis (CF) patients. Moreover, several strains are multidrug resistant. Currently, few antibiotics target its membrane lipids, although it is a very effective protective barrier for P. aeruginosa. The objective of this thesis is to develop a methodology for the lipid analysis of P. aeruginosa strains isolated from patients with chronic lung infections. In a first step, the analytical methods were developed and applied to the laboratory strain P. aeruginosa PAK, allowing us to i) establish the reference lipidome by LC-MS, ii) determine the collision cross sections (physical descriptors) of PAK lipids by ion mobility spectrometry and iii) develop a culture medium (SCFM-PC) mimicking pulmonary mucus and compatible with lipid extraction. In a second step, we worked on 5 isolates of a P. aeruginosa strain isolated from a CF patient suffering from a chronic pulmonary infection (3 isolates in 2008 and 2 in 2018). A first study by non-targeted LC-MS analysis did not allow the determination of the characteristic lipids of each isolate. A second study by non-targeted LC-MS analysis, on two isolates, highlighted the presence of two classes of phospholipids not previously identified and highlighted, by semi-quantification, a different distribution of phospholipids according to the clinical isolate. These methodologies and results constitute a first step for a clinical study on a large cohort of patients.; Pseudomonas aeruginosa est une bactérie très pathogène pour les patients atteints de la mucoviscidose. De plus, certaines souches sont multi-résistante aux antibiotiques. Peu d’antibiotiques actuels ciblent ses lipides membranaires, alors qu’il s’agit d’une barrière de protection très efficace pour P. aeruginosa. L’objectif de cette thèse est de mettre au point une méthodologie permettant l’analyse du lipidome de souches de P. aeruginosa isolées de patients atteint de la mucoviscidose. Dans un premier temps, les méthodes d’analyse ont été développées et appliquées sur la souche de laboratoire P. aeruginosa PAK, nous permettant i) d’établir le lipidome de référence par LC-MS, ii) de déterminer les sections efficaces de collision (descripteurs physiques) des lipides de PAK par spectrométrie de mobilité ionique et iii) de mettre au point un milieu de culture (SCFM-PC) mimant le mucus pulmonaire et compatible avec l’extraction des lipides. Dans un second temps, nous avons travaillé sur 5 isolats d’une souche de P. aeruginosa prélevés sur un patient atteint de la mucoviscidose et souffrant d’une infection pulmonaire chronique (3 isolats en 2008 et 2 en 2018). Une première étude LC-MS non-ciblée n’a pas permis de déterminer les lipides discriminants de chaque isolat, mais a permis de sélectionner deux isolats différentiés pour 2008 et 2018, respectivement. Une seconde étude par analyse LC-MS non-ciblée, sur ces deux isolats, a permis de souligner la présence de deux classes de phospholipides non identifiées chez PAK et de mettre en évidence, par semi-quantification, une répartition différente des phospholipides selon l'isolat clinique. Ces méthodologies et résultats constituent une première étape pour une étude clinique sur une large cohorte de patients. |
| Databáze: |
OpenAIRE |
| Externí odkaz: |
|
