| Popis: |
Tiivistelmä. Elinympäristön biodiversiteetti määrittelee paljon eliöiden saatavilla olevista resursseista ja interaktioista muiden eliöiden kanssa. Ravinnon, petojen ja muun lajiston ohella tärkeä vuorovaikuttava tekijä ovat mikrobit, jotka tarjoavat toiminnallaan sekä hyötyjä että haittoja suuremmille eliöille. Valtaosa monisoluisista eliöistä kerryttää elinkaarensa aikana pinnoilleen ja suolistoonsa mikrobiyhteisön, joka on usein olennaisena osana eliön aineenvaihduntaa ja immuunipuolustusta. Mitkä tekijät vaikuttavat eliön mikrobiyhteisön kehitykseen? Yksi merkittävä tekijä on eliön käyttämä ravinto, jonka sisältämä mikrobisto voi siirtyä suoliston vakituiseen lajistoon. Aihetta on tutkittu vähän luonnonpopulaatioissa, ja vain kahdella trofiatasolla (tuottaja-kuluttaja). Toinen tekijä on elinympäristön biodiversiteetti, jonka tiedetään olevan yhteydessä mikrobiomien lajirikkauteen. Tämä pro gradu -tutkielma tutki ravintoketjusta syntyviä yhteyksiä kasvien ja eläinten mikrobistoon sekä verrata niitä elinympäristön diversiteettiin. Mallisysteeminä käytettiin talitiaisen (Parus major) ravintoketjua: kasvit, perhostoukat, lintu. Ravinnon mukana kulkeutuvaa mikrobistoa ei ole tutkittu kolmella trofiatasolla ennen vuotta 2021 joten tutkimuksen tulokset tuovat arvokasta uutta tietoa siitä, mitä ravintoketjussa tapahtuu bakteerien näkökulmasta. Materiaaliksi kerättiin talitiaisten poikasten ulostetta sekä toukkia ja kasveja pöntön ympäristöstä, joista eristettiin DNA, sekvensoitiin 16S-geeni. Geneettisen materiaalin perusteella kartoitettiin lintujen ja toukkien suolistobakteeriston lajisto ja pesäympäristön kasvien lehdistä löytyvää bakteeristoa. Lajistoa verrattiin näytemateriaalien välillä ja ympäristömuuttujiin, kuten maaperän koostumukseen ja puuston ikään, selvittääksemme mikrobien kulkeutumista ravintoketjussa ja ympäristön vaikutuksia eliöiden mikrobistoon. Sekvensoidusta materiaalista saatiin määriteltyä kasveille, toukille ja linnuille omalaisensa mikrobistot, jotka olivat samankaltaisia aiempien tutkimusten kanssa. Ravintoketjussa kulkeutuvaa mikrobistoa ei onnistuttu havaitsemaan. Ympäristömuuttujilla, etenkin ihmisen vaikutuksella metsään, metsän puulajistolla ja kivennäismaan osuudella maaperästä löytyi korrelaatioita lintujen mikrobiomin lajirikkauden vaihteluihin. |
