KERAGAMAN GENETIK GENERASI 1 SELFING JAGUNG LOKAL TANA TORAJA SULAWESI SELATAN DAN KAROTENOID SYN 3 ASAL CIMMYT BERDASARKAN MARKA MOLEKULER SIMPLE SEQUENCE REPEAT (SSR

Autor: Juhriah, Juhriah, Masniawati, Andi, Alam, Mir
Rok vydání: 2014
Předmět:
Popis: Kekurangan vitamin A merupakan masalah kesehatan masyarakat di lebih dari setengah dari semua negara, dan sebagian besar negara yang terkena berada di Afrika atau Asia Tenggara. Diperkirakan 250 juta anak-anak prasekolah di dunia memiliki kekurangan vitamin A, dan 250 000-500 000 anak-anak tersebut buta setiap tahun. Salah satu karakter spesifik penting dari jagung berhubungan dengan tingginya kandungan karotenoid. Karotenoid dalam biji jagung bermanfaat dalam meningkatkan kandungan gizi dan dapat dikonversi menjadi vitamin A. Penelitian bertujuan menganalis keragaman genetik generasi 1 selfing jagung lokal Tana Toraja Sulawesi Selatan dan Karotenoid Syn 3 asal CIMMYT berdasarkan marka molekuler Simple Sequence Repeat (SSR). Sebanyak 28 sampel tanaman jagung yang bersal 3 sumber benih asal Tana Toraja dan CIMMY, dianalisis dengan menggunakan 5 primer Simple Sequence Repeats (SSR) yang dilaksanakan di Laboratorium Biologi Molekuler Balai Penelitian Tanaman Serealia Maros Sulawesi Selatan. Metode ekstraksi DNA, Polymerase Chain Reaction (PCR) dan elektroforesis mengikuti panduan AMBIONET. Analisis data, kesamaan genetik dan pengelompokan menggunakan program NTSYST. Koefisien kesamaan dihitung menggunakan metode Simple Matching Coefficient (SMC) dan clustering dengan Unweighted Pair Group Aritmathic Analysis (UPGMA). Hasil penelitian menunjukkan bahwa koefisien kesamaan genetik berkisar 0,3 sampai 1,0. Lokal Kandora dengan Karotenoid Syn 3 sampel 7 memiliki nilai kesaaan genetik paling kecil sedangkan 5 sampel jagung lokal asal Tana Toraja yaitu Lokal Toraja (LT4 dengan LT7 dan LK1, LT5 dan LT6) memiliki kesamaan genetik yang terbesar. Matriks korelasi bernilai r = 0.72434. Dendrogram menunjukkan bahwa pada derajat kesamaan genetik 0,70 maka 28 sampel jagung tersebut membentuk 4 kelompok berdasarkan kesamaan genetiknya yaitu kelompok 1 berisi 18 sampel, kelompok 2 beisi 6 sampel , dan lainnya 2 sampel. Beberapa sampel jagung lokal Tana Toraja dapat digalurkan atau disilangkan dengan jagung CIMMYT untuk membentuk galur jagung provitamin A
Databáze: OpenAIRE