Use of bioinformatic tools for the evolutionary analysis of horses

Autor: Loyarte Madoz, Nerea
Přispěvatelé: Sáenz de Miera Carnicer, Luis Enrique, Genetica, Facultad de Ciencias Biologicas y Ambientales
Jazyk: Spanish; Castilian
Rok vydání: 2022
Předmět:
Popis: 27 páginas, ilustraciones [ES] Los caballos han sido esenciales en la historia del ser humano y su evolución sigue siendo discutida. En este trabajo se realizan tres filogenias moleculares, dos de ellas para obtener un filograma de los perisodáctilos utilizando los genes Cytb y Cox3, además de utilizar el D-Loop para obtener un filograma de los caballos modernos. El filograma de los perisodáctilos se realiza para ver la posición evolutiva de los caballos, así como para discutir las relaciones filogenéticas con los fósiles y clados hermanos. El filograma obtenido utilizando las secuencias del D-Loop se realiza para discutir las relaciones filogenéticas de las tres subespecies de caballos modernos actuales (E. f. caballus, E. f. przewalskii y E. f. ferus). Debido a los valores de Bootstrap bajos encontrados en la filogenia de los caballos, se llevó a cabo un análisis de pares de secuencias para la obtención de distintos diagramas de cajas o boxplots. Mediante estos diagramas se ha podido especificar más acerca de los grupos que forman las tres subespecies de caballos modernos [EN] Horses have been esential in human beings’ history and their evolution is still under discussion. In this project three molecular phylogenies are performed, two of them to obtein a phylogram of perisodactyles using the Cytb and Cox3 genes, in addition to using the D-Loop to obtain a phylogram of modern horses. The phylogram of perisodactyls is performed to see the evolutionary position of horses, as well as to discuss phylogenetic relationships with fossils and sister clades. The phylogram obtained using D-Loop sequences is performed to discuss the phylogenetic relationships of the three subespecies of modern horses (E. f. caballus, E. f. przewalskii and E. f. ferus). Due to the low Bootstrap values found in the phylogeny of horses, a sequence pair analysis was carried out to obtain different boxplots. Through these diagrams it has been posible to specify more about the groups that form the three subespecies of modern horses.
Databáze: OpenAIRE