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L'identification de régions génomiques ayant évolué sous l'action de pressions sélectives est un des enjeux majeurs de la recherche en génétique des populations, et de nombreuses méthodes statistiques ont été développées dans ce but. Le travail présente le contexte théorique dans lequel quatre de ces méthodes s'inscrivent et les problématiques qui leur sont liées. Les méthodes présentées sont toutes basées sur un scan génomique estimant la variation du déséquilibre de liaison, mesuré par la statistique EHH ("Extended Haplotype Homozygosity"), développée au début des années 2000 (Sabeti et al. 2002). Deux de ces méthodes, les tests iHS et XP-EHH, sont appliquées à des génomes humains échantillonnés dans quatorze populations du Sahel. Le travail explore différentes applications de ces méthodes, et discute des régions génomiques pour lesquelles le signal retourné par ces tests est extrême par rapport au reste du génome. |
