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RESUMEN La detección de genoma viral mediante la técnica de reacción en cadena de la polimerasa con transcripción inversa en tiempo real (rRT-PCR) para detectar virus SARS CoV-2, se considera como referencia para la definición de caso de enfermedad por coronavirus 2019 (COVID-19) confirmado por laboratorio. Sin embargo, no es lo mismo detectar genoma viral que diagnosticar una enfermedad, y la sensibilidad de detección de la técnica puede exceder la significancia clínica. En microbiología, la jerarquización de un resultado positivo depende de factores como el contexto clínico y epidemiológico, el sitio de toma de muestra y, en muchos casos, la cuantificación del patógeno. Un parámetro fundamental de la rRT-PCR es el ciclo umbral. De su interpretación depende la clasificación de una persona como caso confirmado. Por otro lado, los valores predictivos de una prueba varían según la prevalencia de la patología buscada. Dado que las pruebas positivas obtenidas en diferentes escenarios se consideran de manera equivalente como casos confirmados, con independencia de los signos y síntomas, puede haberse producido una sobrestimación de los casos reales de COVID-19, principalmente en función de testeos realizados en población general. Es fundamental el entrenamiento del personal y la realización de controles de calidad en los laboratorios de diagnóstico, así como definir niveles de corte de ciclo umbral predictivos de infectividad en centros de referencia para minimizar el impacto de resultados falsos en la sociedad. ABSTRACT The detection of the viral genome using the real-time reverse transcription polymerase chain reaction (rRT-PCR) technique to detect the severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS CoV-2) is considered as a reference for the case definition of coronavirus disease 2019 (COVID-19), laboratory confirmed. However, detecting a viral genome is not the same as diagnosing a disease, and its detection sensitivity may exceed clinical significance. In Microbiology, the ranking of a positive result depends on factors such as clinical/epidemiological context, sample collection site and, in many cases, quantification of the pathogen. A fundamental parameter of rRT-PCR is the threshold cycle. The classification of a person as a confirmed case depends on its interpretation. On the other hand, the predictive values of a test vary according to the prevalence of the pathology sought. Given that the positive tests obtained in different scenarios are considered equivalently as confirmed cases, regardless of signs and symptoms, there may have been an overestimation of the real cases of COVID-19 disease, mainly based on tests carried out in the general population. It is essential to train personnel and carry out quality controls in diagnostic laboratories, as well as define threshold cycle cutoff levels that are predictive of infectivity in reference centers, to minimize the impact of false results on society. |
