Estimation of phenotypic diversity in field populations of Magnaporthe grisea from two upland rice cultivars

Autor: Silva, Gisele B., Zambolim, Laércio, Prabhu, Anne S., Araújo, Leila G., Zimmermann, Francisco J.P.
Jazyk: angličtina
Rok vydání: 2007
Předmět:
Zdroj: Fitopatologia Brasileira, Volume: 32, Issue: 1, Pages: 12-5, Published: FEB 2007
Popis: The phenotypic diversity of Magnaporthe grisea was evaluated based on leaf samples with blast lesions collected from eight commercial fields of the upland rice cultivars 'BRS Primavera' and 'BRS Bonança', during the growing seasons of 2001/2002 and 2002/2003, in Goias State. The number of M. grisea isolates from each field utilized for virulence testing varied from 28 to 47. Three different indices were used based on reaction type in the eight standard international differentials and eight Brazilian differentials. The M. grisea subpopulations of ´Primavera' and 'Bonança', as measured by Simpson, Shannon and Gleason indices, showed similar phenotypic diversities. The Simpson index was more sensitive relation than those of Shannon and Gleason for pathotype number and standard deviation utilizing Brazilian differentials. However, the Gleason index was sensitive to standard deviation for international differentials. The sample size did not significantly influence the diversity index. The two sets of differential cultivars used in this study distinguished phenotypic diversity in different ways in all of the eight subpopulations analyzed. The phenotypic diversity determined based on eight differential Brazilian cultivars was lower in commercial rice fields of 'Primavera' than in the fields of 'Bonança,' independent of the diversity index utilized, year and location. Considering the Brazilian differentials, the four subpopulations of 'BRS Primavera' did not show evenness in distribution and only one pathotype dominated in the populations. The even distribution of pathotype was observed in three subpopulations of 'BRS Bonança'. The pathotype diversity of M. grisea was determined with more precision using Brazilian differentials and Simpson index. A diversidade fenotípica de Magnaporthe grisea foi avaliada baseada em amostras de folhas com brusone coletadas de oito lavouras de arroz, 'Primavera' e 'Bonança', durante os anos de 2001/2002 e 2002/2003, no Estado de Goiás. O número de isolados de M. grisea, em cada lavoura, utilizado para teste de virulência variou de 28 a 47. Foram utilizados três diferentes índices baseados no tipo de reação em oito diferenciadoras internacionais e oito diferenciadoras brasileiras. A diversidade fenotípica das subpopulações de M. grisea de 'Primavera' e 'Bonança' foi semelhante pelos índices de Shannon, Simpson e Gleason. O índice de Simpson foi mais sensível do que Shannon e Gleason quanto ao número de patótipo e desvio padrão da freqüência utilizando diferenciadoras brasileiras. Entretanto, o índice de Gleason foi melhor quanto ao número de patótipos e desvio padrão da freqüência, considerando as diferenciadoras internacionais. O tamanho da amostra não influenciou significativamente os índices de diversidade. Os dois conjuntos de diferenciadoras utilizados nesse estudo evidenciaram diversidade fenotípica de diferentes maneiras em todas as oito subpopulações analisadas. A diversidade fenotípica, determinada pelas diferenciadoras brasileiras foi menor nas lavouras de 'Primavera' do que em 'Bonança', independente do índice, ano e local. Considerando as diferenciadoras brasileiras, as quatro subpopulações de 'Primavera' não mostraram distribuição uniforme, predominando apenas um patótipo nas subpopulações. A distribuição uniforme de patótipos foi observada em três subpopulações de 'Bonança'. A diversidade de patótipos de M. grisea foi determinada com maior precisão combinando as diferenciadoras brasileiras e o índice de Simpson.
Databáze: OpenAIRE
Popis
Abstrakt:The phenotypic diversity of Magnaporthe grisea was evaluated based on leaf samples with blast lesions collected from eight commercial fields of the upland rice cultivars 'BRS Primavera' and 'BRS Bonança', during the growing seasons of 2001/2002 and 2002/2003, in Goias State. The number of M. grisea isolates from each field utilized for virulence testing varied from 28 to 47. Three different indices were used based on reaction type in the eight standard international differentials and eight Brazilian differentials. The M. grisea subpopulations of ´Primavera' and 'Bonança', as measured by Simpson, Shannon and Gleason indices, showed similar phenotypic diversities. The Simpson index was more sensitive relation than those of Shannon and Gleason for pathotype number and standard deviation utilizing Brazilian differentials. However, the Gleason index was sensitive to standard deviation for international differentials. The sample size did not significantly influence the diversity index. The two sets of differential cultivars used in this study distinguished phenotypic diversity in different ways in all of the eight subpopulations analyzed. The phenotypic diversity determined based on eight differential Brazilian cultivars was lower in commercial rice fields of 'Primavera' than in the fields of 'Bonança,' independent of the diversity index utilized, year and location. Considering the Brazilian differentials, the four subpopulations of 'BRS Primavera' did not show evenness in distribution and only one pathotype dominated in the populations. The even distribution of pathotype was observed in three subpopulations of 'BRS Bonança'. The pathotype diversity of M. grisea was determined with more precision using Brazilian differentials and Simpson index. A diversidade fenotípica de Magnaporthe grisea foi avaliada baseada em amostras de folhas com brusone coletadas de oito lavouras de arroz, 'Primavera' e 'Bonança', durante os anos de 2001/2002 e 2002/2003, no Estado de Goiás. O número de isolados de M. grisea, em cada lavoura, utilizado para teste de virulência variou de 28 a 47. Foram utilizados três diferentes índices baseados no tipo de reação em oito diferenciadoras internacionais e oito diferenciadoras brasileiras. A diversidade fenotípica das subpopulações de M. grisea de 'Primavera' e 'Bonança' foi semelhante pelos índices de Shannon, Simpson e Gleason. O índice de Simpson foi mais sensível do que Shannon e Gleason quanto ao número de patótipo e desvio padrão da freqüência utilizando diferenciadoras brasileiras. Entretanto, o índice de Gleason foi melhor quanto ao número de patótipos e desvio padrão da freqüência, considerando as diferenciadoras internacionais. O tamanho da amostra não influenciou significativamente os índices de diversidade. Os dois conjuntos de diferenciadoras utilizados nesse estudo evidenciaram diversidade fenotípica de diferentes maneiras em todas as oito subpopulações analisadas. A diversidade fenotípica, determinada pelas diferenciadoras brasileiras foi menor nas lavouras de 'Primavera' do que em 'Bonança', independente do índice, ano e local. Considerando as diferenciadoras brasileiras, as quatro subpopulações de 'Primavera' não mostraram distribuição uniforme, predominando apenas um patótipo nas subpopulações. A distribuição uniforme de patótipos foi observada em três subpopulações de 'Bonança'. A diversidade de patótipos de M. grisea foi determinada com maior precisão combinando as diferenciadoras brasileiras e o índice de Simpson.