Evaluation eines mit Hilfe von Lysozym- und Ultraschallbehandlung hergestellten E. coli-Zellextraktes und Transkriptionsinterferenz in Toehold-Switch-basierten Netzwerken
| Autor: | Falgenhauer, Elisabeth |
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| Přispěvatelé: | Simmel, Friedrich C. (Prof. Dr.), Gerland, Ulrich (Prof. Dr.) |
| Jazyk: | angličtina |
| Rok vydání: | 2022 |
| Předmět: |
Physik
antisense RNA transcriptional interference gene regulation bacterial extract cell-free protein expression phage assembly mass spectroscopy proteomics ddc:660 ddc:530 Chemische Verfahrenstechnik Antisense RNA Transkriptionsinterferenz Genregulation bakterielles Zellextrakt zellfreie Proteinexpression Phagenassemblierung Massenspektrometrie Proteomics |
| Popis: | Genetic circuits can be studied either in vivo or within cell-free systems. One of the crucial steps during the preparation of cell extract is the cell lysis procedure. In this study we prepared E. coli cell extract using a combination of lysozyme incubation and sonication cycles for the lysis step. In a second project regulatory RNAs (toehold switches, triggers and anti-triggers) were studied within different promoter arrangements in vivo and transcriptional interference effects were analyzed. Genetische Netzwerke können in vivo oder in zellfreien Systemen untersucht werden. Ein kritischer Schritt bei der Herstellung von Zellextrakt ist die Zelllyse. In dieser Arbeit wurde E. coli-Zellextrakt mit Hilfe einer Kombination aus Lysozyminkubation und Ultraschallzyklen hergestellt. In einem zweiten Projekt wurden regulatorische RNAs (Toehold-Switches, Trigger und Anti-Trigger) innerhalb von verschiedenen Promotoranordnungen untersucht, wobei Transkriptionsinterferenz auftritt. |
| Databáze: | OpenAIRE |
| Externí odkaz: |
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