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The covalent binding partners of the electrophilic natural products falcarinol and neocarzilins A-C were identified applying ABPP (Activity based protein profiling) in human cancer cells. Potential targets obtained by quantitative mass spectrometry were confirmed using activity based assays, imaging and binding site identification. The application of photocrosslinkers to identify noncovalent interactions and the synthesis of minimal photoprobes with embedded photoreactive moieties led to the identification of a whole proteome inventory of background photocrosslinker binding in human cancer cells. Die kovalenten Interaktionspartner der elektrophilen Naturstoffe Falcarinol und der Neocarziline A-C wurden mittels ABPP (Aktivitäts-basiertes Protein-Profiling) identifiziert. Die Hits, welche durch quantitative Massenspektrometrie erhalten wurden, konnten mittels Aktivitätsassays, Imaging und Identifizierung der Bindungsstelle validiert werden. Die Anwendung von Foto-Crosslinkern bei der Identifizierung reversibler Interaktionspartner und die Synthese minimalistischer Fotosonden führte zur Erstellung eines Inventars unspezifischer Bindungspartner von Foto-Crosslinkern im Proteom humaner Krebszellen. |
