Complete genomic, comparative genomic and post-genomic analysis of lactic acid bacteria : No. 5
| Autor: | Hidetoshi, Morita, Kenshiro, Oshima, Hidehiro, Toh, Toshio, Masaoka, Shiro, Chinone, Yasunori, Wada, Kazuyoshi, Arishima, Akio, Kiuchi, Ryoichi, Sakata, Masao, Shino, Hiroyuki, Naito, Yasuhide, Saito, Toshiho, Nishita, Nobuyuki, Kanemaki, Tatsuya, Takizawa, Yukio, Kato, Masaru, Murakami, Masafumi, Fukuyama, Seigo, Kishikawa, Shin, Hisamatsu, Tetsuhiko, Yoshimura, Tadayoshi, Shiba, Masahira, Hattori |
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| Jazyk: | japonština |
| Rok vydání: | 2008 |
| Zdroj: | 麻布大学雑誌 = Journal of Azabu University. :305-308 |
| ISSN: | 1346-5880 |
| Popis: | Bifidobacterium属は,高いプロバイオティクス効果および細菌の分類学のモデルケースとして興味深い状況にある。(独)理化学研究所バイオリソースセンター微生物材料開発室(JCM)に保存されているBifidobacterium属およびその近縁種で,ヒトを分解源とする基準株を検索したところ,9菌種(菌株)が候補としてあげられ,その全ゲノム解析を開始した。その菌種は,Table 1に示したとおりであるが,B. bifidum, B. breveおよびB. catenulatumの3菌種は全ゲノム配列を決定し,B. dentium, P. denticolens, S. inopinataおよびG. vaginalisの3菌種は,コンティグが15前後になっており,B. longumおよびb. scarcoviiについては,ショットガンライブラリの作製を完了した。各菌株について引き続きシークエンス作業を進め,全ゲノム解析後は,大規模なBifidobacterium属の比較ゲノム解析を行う予定である。 It is interested in Genus Bifidobacterium shows the probiotic effects and as the model case of taxonomy. The nine species of Bifidobacterium and the closest related species of the type strains isolated from human origin were obtained from the Microbe Division, Japan Collection of Microorganisms (JCM), RIKEN BioResource Center. We have started sequencing of the complete genome of nine species. We have done the complete genome sequencing of B. bifidum, B. breve and B. catenulatum. The contigs of Parascardovia denticolens, Scardovia inopinata and Gardnerella vaginalis is less than fifteen. The draft sequences of B. dentium genomes have been obtained, and the shotgun library of the B. scardovii and B. longum genomes were prepared. We are going to widely comparative genomics in the Family Bifidobacteriaceae, when all the genomes will be finished. |
| Databáze: | OpenAIRE |
| Externí odkaz: |
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