CYGD: the Comprehensive Yeast Genome Database
Autor: | José E. Pérez-Ortín, Gabi Kastenmüller, Ulrich Güldener, Emmanuel Talla, Claude Gaillardin, José García-Martínez, Jean Luc Souciet, Hans-Werner Mewes, H. Michael, Bernard Dujon, Elisabeth Bon, J. Richelles, Normann Strack, J. van Helden, Andreas Kaps, Bernard Andre, Martin Münsterkötter, Christian Lemer, J. de Montigny, Shoshana J. Wodak |
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Přispěvatelé: | Technische Universität Munchen - Université Technique de Munich [Munich, Allemagne] (TUM), Institute for Bioinformatics (MIPS), GSF National Research Center for Environment and Health, Bureau de Recherches Géologiques et Minières (BRGM) (BRGM), Neuroimagerie cognitive (LCogn), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut de biologie et chimie des protéines [Lyon] (IBCP), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Evolution, Génomes et Spéciation (LEGS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Génétique Moléculaire des Levures, Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives - Laboratoire d'Electronique et de Technologie de l'Information (CEA-LETI), Direction de Recherche Technologique (CEA) (DRT (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Sciences Techniques Éducation Formation (STEF), École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-École normale supérieure - Cachan (ENS Cachan), Dynamique, évolution et expression de génomes de microorganismes (DEEGM), Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Génétique moléculaire, génomique, microbiologie (GMGM), Laboratoire (INRA UMR216-URA1925), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National Agronomique Paris-Grignon (INA P-G), Collection de Levures d'Intérêt Biotechnologique et Laboratoire de Génétique Moléculaire et Cellulaire, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de génétique moléculaire et cellulaire, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Microbiologie et Génétique Moléculaire (MGM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National Agronomique Paris-Grignon (INA P-G)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), École normale supérieure - Cachan (ENS Cachan)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon), Technische Universität München [München] (TUM), Laboratoire d'Electronique et des Technologies de l'Information (CEA-LETI), Université Grenoble Alpes (UGA)-Direction de Recherche Technologique (CEA) (DRT (CEA)), École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-École normale supérieure - Cachan (ENS Cachan), Laboratoire de Génétique Moléculaire et Cellulaire (INRA UMR216-URA1925), Bon, Elisabeth |
Jazyk: | angličtina |
Rok vydání: | 2005 |
Předmět: |
ved/biology.organism_classification_rank.species
SACCHAROMYCES CEREVISIAE GENOME COMPREHENSIVE YEAST GENOME DATABASE CYGD PROTEIN INTERACTION EUROPEAN CONSORTIUM SEQUENCE INFORMATION YEAST GENOME SEQUENCED EUKARYOTIC GENOME computer.software_genre Genome Saccharomyces User-Computer Interface Sequence Analysis Protein Databases Genetic [INFO.INFO-BI] Computer Science [cs]/Bioinformatics [q-bio.QM] 0303 health sciences [SDV.BIBS] Life Sciences [q-bio]/Quantitative Methods [q-bio.QM] biology Database 030302 biochemistry & molecular biology Articles Genomics [SDV.BIBS]Life Sciences [q-bio]/Quantitative Methods [q-bio.QM] nucleic acids Bio-informatique Genome Fungal Saccharomyces cerevisiae Proteins Bioinformatics Saccharomyces cerevisiae Genètica molecular 03 medical and health sciences Annotation Genetics SIMAP Model organism Gene 030304 developmental biology Binding Sites ved/biology Membrane Proteins Membrane Transport Proteins biology.organism_classification Yeast [INFO.INFO-BI]Computer Science [cs]/Bioinformatics [q-bio.QM] computer SDV:BIBS Transcription Factors |
Zdroj: | Nucleic Acids Research Nucleic Acids Research, 2005, 33 (Database issue), pp.D364-8. ⟨10.1093/nar/gki053⟩ Nucleic Acids Research Database issue (33), D364-8. (2005) Nucleic Acids Research, Oxford University Press, 2005, 33 (Database issue), pp.D364-8. ⟨10.1093/nar/gki053⟩ Güldener, U Münsterkötter, M. Kastenmüller, G Strack1, N van Helden, J. Lemer, C. Richelles, J. Wodak, S.J. García Martínez, José Pérez Ortín, José E. Michael, H. Kaps, A. Talla, E. Dujon, B. André, B. Souciet, J.L. De Montigny, J. Bon, E. Gaillardin, C. Mewes, H.W. 2005 CYGD: The Comprehensive Yeast Genome Database. Nucleic Acids Research 33 suppl 1 D364 D368 RODERIC. Repositorio Institucional de la Universitat de Valéncia instname Nucleic Acids Research 33, D364-D368. (2005) Nucleic Acids Res. 33, SI, D364-368 (2005) |
ISSN: | 0305-1048 1362-4962 |
Popis: | The comprehensive resource is available under http://mips.gsf.de/genre/proj/yeast/.; International audience; The Comprehensive Yeast Genome Database (CYGD) compiles a comprehensive data resource for information on the cellular functions of the yeast Saccharomyces cerevisiae and related species, chosen as the best understood model organism for eukaryotes. The database serves as a common resource generated by a European consortium, going beyond the provision of sequence information and functional annotations on individual genes and proteins. In addition, it provides information on the physical and functional interactions among proteins as well as other genetic elements. These cellular networks include metabolic and regulatory pathways, signal transduction and transport processes as well as co-regulated gene clusters. As more yeast genomes are published, their annotation becomes greatly facilitated using S.cerevisiae as a reference. CYGD provides a way of exploring related genomes with the aid of the S.cerevisiae genome as a backbone and SIMAP, the Similarity Matrix of Proteins. The comprehensive resource is available under http://mips.gsf.de/genre/proj/yeast/. |
Databáze: | OpenAIRE |
Externí odkaz: |