Evolutionary diversification of type-2 HDAC structure, function and regulation in Nicotiana tabacum
| Autor: | Emilie Julio, David Wendehenne, Benjamin Liegard, Valérie Nicolas-Francès, Vincent Grandperret, Sébastien Aimé, Olivier Lamotte, Stéphane Bourque, François Dorlhac de Borne, Agnès Klinguer, Damien Vasselon, Sylvain Jeandroz |
|---|---|
| Přispěvatelé: | Agroécologie [Dijon], Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Laboratoire de Biotechnologie et Chimie Marines (LBCM), Université de Bretagne Sud (UBS)-Université de Brest (UBO)-Institut Universitaire Européen de la Mer (IUEM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Ministère de l'Education Nationale et de la Recherche, Conseil Régional de Bourgogne (PARI AGRALE8), Association pour la Recherche sur les Nicotianacées, Conseil Régional de Bourgogne, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) |
| Jazyk: | angličtina |
| Rok vydání: | 2018 |
| Předmět: |
0106 biological sciences
0301 basic medicine Nicotiana tabacum Plant Science 01 natural sciences Evolution Molecular Type-2 HDAC (HD2) 03 medical and health sciences Phylogenetics Zinc finger Tobacco Genetics Arabidopsis thaliana Gene family [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology Amino Acid Sequence Gene Phylogeny Solanaceae Plant Proteins biology Models Genetic Intron Zinc Fingers General Medicine Salt Tolerance biology.organism_classification Salt stress response Complementation 030104 developmental biology Histone DeACetylase (HDAC) Agronomy and Crop Science Sequence Alignment 010606 plant biology & botany |
| Zdroj: | Plant Science Plant Science, Elsevier, 2018, 269, pp.66-74. ⟨10.1016/j.plantsci.2018.01.007⟩ |
| ISSN: | 0168-9452 |
| Popis: | Ministère de l'Education Nationale et de la Recherche ; Conseil Régional de Bourgogne (PARI AGRALE8) ; Association pour la Recherche sur les Nicotianacées ; Conseil Régional de Bourgogne; International audience; Type-2 HDACs (HD2s) are plant-specific histone deacetylases that play diverse roles during development and in responses to biotic and abiotic stresses. In this study we characterized the six tobacco genes encoding HD2s that mainly differ by the presence or the absence of a typical zinc finger in their C-terminal part. Of particular interest, these HD2 genes exhibit a highly conserved intron/exon structure. We then further investigated the phylogenetic relationships among the HD2 gene family, and proposed a model of the genetic events that led to the organization of the HD2 family in Solanaceae. Absolute quantification of HD2 mRNAs in N. tabacum and in its precursors, N. tomentosiformis and N. sylvestris, did not reveal any pseudogenization of any of the HD2 genes, but rather specific regulation of HD2 expression in these three species. Functional complementation approaches in Arabidopsis thaliana demonstrated that the four zinc finger-containing HD2 proteins exhibit the same biological function in response to salt stress, whereas the two HD2 proteins without zinc finger have different biological function. |
| Databáze: | OpenAIRE |
| Externí odkaz: |
|
Full Text from ScienceDirect