Diversity of magnetotactic bacteria from a French Pristine Mediterranean Area
Autor: | Anne Postec, Maxime Fuduche, Agnès Hirschler-Réa, Jean-Paul Chauvin, Nathalie Pradel, Grégoire Galès, Sylvain Davidson, Bernard Ollivier, Long-Fei Wu |
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Přispěvatelé: | Institut méditerranéen d'océanologie (MIO), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Toulon (UTLN), Institut de Biologie du Développement de Marseille (IBDM), Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre européen de recherche et d'enseignement des géosciences de l'environnement (CEREGE), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Collège de France (CdF (institution))-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Laboratoire de chimie bactérienne (LCB), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Toulon (UTLN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut méditerranéen d'océanologie ( MIO ), Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Aix Marseille Université ( AMU ) -Université de Toulon ( UTLN ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut de Biologie du Développement de Marseille ( IBDM ), Aix Marseille Université ( AMU ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire de chimie bactérienne ( LCB ), Aix Marseille Université ( AMU ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) |
Rok vydání: | 2015 |
Předmět: |
DNA
Bacterial [ SDU.OCEAN ] Sciences of the Universe [physics]/Ocean Atmosphere Greigite Mediterranean climate Magnetotactic bacteria Iron Molecular Sequence Data Magnetosome Sulfides 010501 environmental sciences Biology DNA Ribosomal 01 natural sciences Applied Microbiology and Biotechnology Microbiology 03 medical and health sciences Mediterranean sea RNA Ribosomal 16S Mediterranean Sea Cluster Analysis 14. Life underwater Phylogeny Soil Microbiology Alphaproteobacteria 030304 developmental biology 0105 earth and related environmental sciences [SDU.OCEAN]Sciences of the Universe [physics]/Ocean Atmosphere Microscopy 0303 health sciences Phylogenetic tree Ecology Aquatic ecosystem Sequence Analysis DNA General Medicine respiratory system 16S ribosomal RNA Ferrosoferric Oxide France |
Zdroj: | Current Microbiology Current Microbiology, Springer Verlag, 2015, 70 (4), pp.499-505. ⟨10.1007/s00284-014-0745-y⟩ Current Microbiology, 2015, 70 (4), pp.499-505. ⟨10.1007/s00284-014-0745-y⟩ Current Microbiology, Springer Verlag, 2015, 70 (4), pp.499-505. 〈10.1007/s00284-014-0745-y〉 |
ISSN: | 0343-8651 1432-0991 |
Popis: | International audience; Magnetotactic bacteria synthesize intracellular magnetite and/or greigite magnetosome crystals. They play a significant role in both iron and sulfur cycles in sedimentary aquatic environments. To get insight into the bio-geochemical contribution of MTB, more studies concerning their ecology and their distribution in diverse habitats are necessary. The MTB community of an oil-industry polluted area of the French Mediterranean coast has been previously investigated. Here, we investigate the MTB community from coastal sediments of a Mediterranean pristine area using optical and transmission electron microscopy and phylogenetic analysis based on 16S rRNA gene sequences. A particularly high diversity of MTB was observed, with cocci phylogenetically distributed across the order Magnetococcales, including a novel cluster with sequences from the Mediterranean Sea designated as "Med group", and novel morphotypes. |
Databáze: | OpenAIRE |
Externí odkaz: |